基於結構的藥物及其他生物活性分子設計--工具和策略 pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

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藥明... 編

圖書標籤:

• 藥物設計
• 基於結構藥物設計
• 生物活性分子
• 分子建模
• 計算化學
• 藥物發現
• 結構生物學
• 計算機輔助藥物設計
• QSAR
• 分子對接

店鋪： 土星圖書專營店

齣版社： 科學

ISBN：9787030509482

商品編碼：26345881501

開本：16

齣版時間：2017-01-01

基本信息

• 商品名稱：基於結構的藥物及其他生物活性分子設計--工具和策略
• 作者：(美)阿倫·戈什//桑德拉·吉瑪|譯者:藥明康德新藥開發有限公司
• 定價：190
• 齣版社：科學
• ISBN號：9787030509482

其他參考信息（以實物為準）

• 齣版時間：2017-01-01
• 印刷時間：2017-01-01
• 版次：1
• 印次：1
• 開本：16開
• 包裝：平裝
• 頁數：372
• 字數：421韆字

內容提要

由阿倫·戈什、桑德拉·吉瑪原著的《基於結構 的藥物及其他生物活性分子設計--工具和策略》是國 際知名藥物化學專傢，美國普渡大學AruTl K．Ghosh 教授和意大利锡耶納大學Sandra Gemma教授閤著的《 基於結構的藥物和生物活性分子設計分的中譯本。
    Gihosh教授曾在美國默沙東公司從事基於結構的藥物 設計研究，他設計研發的抗艾滋病藥物Darunavir已 經FDA批準上市，為治療艾滋病領域的重大研究成果 。本書凝聚瞭作者及其所領導實驗室的大量研究成果 。在迴顧瞭小分子藥物研發的曆史之後，作者闡述瞭 基於結構藥物設計的基本概念、工具和方法，以近年 在歐美上市的經典藥物為例，深入淺齣地為讀者介紹 瞭其研發曆程。本書內容豐富，除瞭介紹藥物研發理 念、工具，還藉助生動的研發實例進行闡述，使得藥 物研發的精彩和艱辛躍然紙上，同時作者還附上瞭大 量的參考文獻以饗讀者。
     本書對大學高年級學生、研究生及從事藥物研發 科研人員、醫藥企業藥物研發管理人員都有重要的參 考價值。
     版權所有。譯本經授權譯自威利齣版的英文版圖 書。
    

目錄

譯者的話
中文版序
作者序
第1章 從傳統藥物到現代藥物：基於結構藥物設計的曆史迴顧
1.1 引言
1.2 1928一1980年期間的藥物研發
1.3 基於結構的藥物設計的起源
1.4 結論
**部分 基於結構藥物設計的基本概念、工具、配體以及多樣化的化閤物骨架
第2章 天鼕氨酸蛋白酶抑製劑的設計
2.1 引言
2.2 天鼕氨酸蛋白酶類肽抑製劑的設計
2.3 基於statinc的抑製劑設計
2.4 基於羥基亞甲基等排體抑製劑的設計
2.5 基於羥乙胺等排體抑製劑的設計
2.5.1 光學活性的.一氨烷基取代的環氧化物的閤成
2.6 基於羥乙基脲的抑製劑的設計
2.7 基於羥乙基磺酰胺的抑製劑
2.8 雜環／非類肽天鼕氨酸蛋白酶抑製劑的設計
2.8.1 基於羥基香豆素和羥基吡喃酮的抑製劑
2.8.2 基於取代呱啶的抑製劑的設計
2.8.3 基於二氨基嘧啶的抑製劑的設計
2.8.4 基於酰基胍的抑製劑的設計
2.8.5 基於氨基吡啶的抑製劑的設計
2.8.6 基於氨基咪唑和氨基乙內酰脲的抑製劑的設計
2.9 結論
第3章 絲氨酸蛋白酶抑製劑的設計
3.1 引言
3.2 絲氨酸蛋白酶的催化機製
3.3 絲氨酸蛋白酶抑製劑的類型
3.4 鹵代甲基酮類抑製劑
3.5 膦酸二苯酯類抑製劑
3.6 三氟甲基酮類抑製劑
3.6.1 三氟甲基酮類化閤物的閤成
3.7 肽基硼酸類抑製劑
3.7.1 α一氨基烷基硼酸衍生物的閤成
3.8 肽基α一酮酰胺和.一酮雜環類抑製劑
3.8.1 α一羰基酰胺類和.一羰基雜環類化閤物的閤成
3.9 基於雜環化閤物設計絲氨酸蛋白酶抑製劑
3.9.1 異香豆素衍生的不可逆抑製劑
3.9.2 β一內酰胺衍生的不可逆抑製劑
3.10 可逆的／非共價抑製劑
3.11 結論
第4章 蛋白酶體抑製劑的設計
4.1 引言
4.2 20S蛋白酶體的催化機製
4.3 蛋白酶體抑製劑
4.3.1 硼酸型蛋白酶體抑製劑的開發
4.3.2 基於β一內酯天然産物的蛋白酶體抑製劑的開發
4.3.3 環氧酮衍生物類抑製劑的開發
4.3.4 非共價型蛋白酶體抑製劑
4.4 β一內酯骨架的製備
4.5 環氧酮骨架的製備
……
第5章 半胱氨酸蛋白酶抑製劑設計
第6章 金屬蛋白酶抑製劑的設計
第7章 基於結構的蛋白激酶抑製劑設計
第8章 蛋白質X射綫晶體學在基於結構藥物的分子設計中的應用
第9章 GPCR藥物設計
第二部分 基於結構設計研發的FDA批準上市藥物和臨床在研分子
**0章 血管緊張素轉化酶抑製劑用於治療高血壓：卡托普利的設計和發現
**1章 用於HⅣ感染和AIDS治療的HIV一1蛋白酶抑製劑：沙奎那韋、茚地那韋和達蘆那韋的藥物設計
**2章 蛋白激酶抑製劑靶嚮癌癥治療藥物：伊馬替尼、尼洛替尼、巴氟替尼和達沙替尼的設計和發現
**3章 NS3／4A絲氨酸蛋白酶抑製劑治療丙肝病毒：波普瑞韋和替拉瑞韋的設計和發現
**4章 蛋白酶體抑製劑用於多發性骨髓瘤的治療：硼替佐米和卡非佐米的設計和發現
**5章 直接凝血酶抑製劑用於治療血栓：抗凝血藥物達比加群酯的研發
**6章 用於治療HIV／AIDS的非核苷類反轉錄酶抑製劑：依麯韋林和利匹韋林的設計及開發
**7章 用於治療高血壓的腎素抑製劑：阿利吉侖的設計與開發
**8章 用於治療流感病毒神經氨酸酶抑製劑：紮那米韋和奧司他韋的設計與發現
**9章 碳酸酐酶抑製劑治療青光眼一多佐胺的設計和開發
第20章 β-泌酶抑製劑用於阿爾茨海默病的治療一一臨床前和臨床抑製劑研究
索引

探索分子世界的精妙藝術：從理論到實踐的藥物與生物活性分子設計之旅 在生命的微觀尺度上，分子扮演著至關重要的角色，它們是構成一切生命活動的基礎，也是乾預疾病、促進健康的強大工具。從抗生素到抗癌藥物，從診斷試劑到基因療法，人類在理解和操控生物分子層麵不斷取得突破。而這一切的背後，都離不開對分子結構與功能之間深刻關係的洞察，以及在此基礎上進行的精妙設計。本書將帶領讀者深入探索這一引人入勝的領域，解鎖基於結構進行藥物及其他生物活性分子設計的奧秘，揭示其背後所依賴的強大工具與創新策略。 一、理解分子之舞：結構與功能的協同共振 要設計齣有效的藥物和生物活性分子，首要任務便是深入理解目標分子的三維結構以及其在生物體內的功能。生命體內的分子，無論是蛋白質、核酸、糖類還是脂質，都擁有其獨特的空間構象。這種構象並非一成不變，而是與周圍環境、與其他分子的相互作用息息相關，最終決定瞭其生物活性。 蛋白質的精密摺疊與催化之能： 蛋白質是生命活動的執行者，它們的多樣化功能，從催化化學反應（酶）、傳遞信號（受體）、運輸物質（載體蛋白）到構成細胞骨架（結構蛋白），都與其精確的三維摺疊息息相關。研究蛋白質的氨基酸序列如何決定其空間結構，以及結構如何影響其與底物、配體或其他分子的結閤，是藥物設計的基石。例如，理解酶的活性位點結構，可以設計齣能夠特異性抑製或激活酶活性的分子，從而達到治療疾病的目的。 核酸的遺傳密碼與信息傳遞： DNA和RNA是生命的藍圖和信使。它們以堿基序列的形式儲存和傳遞遺傳信息，其雙螺鏇結構和核苷酸的配對規律是理解遺傳、突變和基因錶達調控的關鍵。針對核酸的藥物設計，例如反義寡核苷酸療法，就依賴於精確匹配目標核酸序列，從而乾擾疾病相關的基因錶達。 小分子相互作用的化學邏輯： 除瞭生物大分子，許多重要的生物活性分子本身就是小分子，如激素、神經遞質、維生素等。理解這些小分子與它們在體內結閤的靶點（通常是蛋白質）之間的相互作用模式，例如氫鍵、離子鍵、範德華力、疏水相互作用等，是設計能夠模擬、阻斷或調節這些相互作用的藥物的關鍵。 二、精準的“鑰匙”與“鎖”：結構導嚮的藥物設計（Structure-Based Drug Design, SBDD） 本書的核心，便是“基於結構”的設計理念。這意味著我們將跳齣傳統的“試錯法”或“高通量篩選”的局限，轉而利用已知或預測的目標分子三維結構信息，主動設計與目標分子特異性結閤，並産生期望生物活性的分子。這就像為一把鎖（靶點）精心打造一把能夠完美契閤的鑰匙（藥物）。 三維結構的獲取： 無論是通過實驗手段如X射綫晶體學、核磁共振（NMR）光譜學，還是通過計算方法如同源建模、從頭預測，獲得高分辨率的目標分子三維結構是SBDD的第一步，也是至關重要的一步。精確的結構信息如同為設計者提供瞭藍圖。 靶點分析與識彆： 瞭解疾病發生機製，識彆與疾病發生發展密切相關的“靶點”是SBDD的前提。靶點可能是異常活躍的酶、失調的受體、緻病性的病毒蛋白，甚至是癌細胞錶麵的特定標記物。對靶點進行深入的功能和結構分析，有助於確定其潛在的藥物結閤位點（binding site）或活性位點（active site）。 分子對接（Molecular Docking）： 一旦獲得瞭靶點結構和潛在的藥物分子庫，分子對接技術便成為連接這兩者的橋梁。它通過計算模擬，預測小分子與靶點之間的最優結閤姿態和結閤親和力。這項技術可以幫助研究者從數百萬甚至數十億的化閤物中，篩選齣最有潛力的候選分子，極大地提高瞭效率。 分子動力學模擬（Molecular Dynamics, MD）： 真實生物體係中的分子並非靜止不動，它們在不斷地運動和構象變化。分子動力學模擬能夠模擬分子的動態行為，揭示分子在溶液中的柔性、構象變化以及與環境的相互作用，為理解結閤過程、評估藥物穩定性以及優化分子設計提供更深層次的洞察。 虛擬篩選（Virtual Screening）： 基於結構的虛擬篩選技術，利用計算方法從大型化閤物庫中快速篩選齣與靶點具有高結閤潛力的分子。這包括形狀匹配、能量評分等多種策略，能夠顯著縮減需要進行實驗驗證的化閤物數量。 三、超越藥物：生物活性分子的廣闊天地 本書的內容遠不止於傳統意義上的藥物設計。在現代生物技術和醫學領域，對具有特定生物活性的分子的需求日益增長，它們的應用範圍也越來越廣泛。 診斷試劑的設計： 能夠特異性識彆疾病標誌物（如特定蛋白、核酸序列）的探針分子，是開發高靈敏度、高特異性診斷試劑的關鍵。基於結構的分子設計，可以幫助我們設計齣能夠高效結閤這些標誌物的抗體片段、核酸適配體，甚至小分子熒光探針。 生物傳感器與成像劑： 設計能夠響應特定生物信號並産生可檢測信號的分子，是構建高精度生物傳感器和開發新型生物成像劑的基礎。例如，設計能夠與特定細胞器結閤並發齣熒光的分子，可以用於實時觀察細胞內部的動態過程。 基因編輯工具的優化： CRISPR-Cas9等基因編輯技術的齣現，極大地改變瞭我們操控基因的能力。然而，這些工具的脫靶效應和遞送效率仍是挑戰。基於對Cas9蛋白與DNA相互作用的結構理解，可以設計齣更高特異性、更低脫靶率的Cas9變體，或優化引導RNA的設計，以提高編輯效率和安全性。 蛋白質工程與酶的改造： 通過對天然蛋白質進行結構改造，我們可以賦予它們新的功能，例如提高其催化效率、改變其底物特異性、增強其穩定性。這在生物催化、生物修復等領域具有巨大的應用潛力。 四、創新工具與前沿策略：驅動分子設計引擎 要實現精準高效的分子設計，強大的計算工具和創新的策略是不可或缺的。 高性能計算與人工智能（AI）的應用： 隨著計算能力的飛速提升，復雜的分子模擬和大規模數據分析成為可能。人工智能，特彆是機器學習和深度學習，在預測分子性質、識彆潛在藥物靶點、優化分子結構等方麵展現齣前所未有的潛力，正在深刻地改變著分子設計的範式。 計算化學軟件與數據庫： 一係列成熟的計算化學軟件，如AutoDock, GROMACS, AMBER, Schrodinger Suite等，為分子對接、動力學模擬、量子化學計算提供瞭強大的支持。同時，各種大型的化閤物數據庫、蛋白質結構數據庫（如PDB）、基因組數據庫等，為研究者提供瞭海量的數據資源。 組閤化學與高通量閤成： 結閤計算預測，組閤化學技術可以快速閤成大量的結構類似物，為驗證計算結果、發現新結構提供實驗支持。高通量篩選技術則能快速評估這些分子的生物活性，形成“設計-閤成-測試”的閉環。 生物信息學與數據科學： 整閤基因組學、蛋白質組學、轉錄組學等多組學數據，利用生物信息學和數據科學的方法，能夠更全麵地理解疾病的分子機製，發現新的藥物靶點，並為分子設計提供更宏觀的視角。 五、從理論到實踐的轉化：挑戰與機遇 基於結構的藥物及其他生物活性分子設計，是一個集理論、計算與實驗於一體的交叉學科領域。盡管取得瞭巨大的成就，但仍麵臨諸多挑戰。如何提高預測的準確性，如何在動態變化的生物環境中進行精準設計，如何剋服藥物的體內代謝、毒副作用等問題，以及如何將計算預測與實驗驗證緊密結閤，高效推進研發進程，是每一位分子設計者需要不斷探索和解決的課題。 本書旨在為廣大科研工作者、學生以及對這一領域感興趣的讀者，提供一個係統、深入的學習平颱。通過對基本原理的闡述，對先進工具的介紹，以及對創新策略的探討，我們希望能夠激發讀者對分子世界的好奇心，掌握精準設計分子工具的能力，從而在藥物研發、疾病治療、生命科學探索等諸多領域，貢獻自己的智慧和力量。這是一個充滿挑戰，但更充滿機遇的時代，讓我們一同踏上這場探索分子世界的精妙藝術之旅。

評分☆☆☆☆☆

我剛翻閱瞭這本《基於結構的藥物及其他生物活性分子設計--工具和策略》，雖然我還沒有深入研讀，但初步的瀏覽已經讓我對這本書的潛力和價值有瞭深刻的認識。首先，我被其內容的宏大視野所吸引。它似乎不僅僅局限於某個特定的研究領域，而是試圖勾勒齣一個更加廣闊的藥物發現和分子設計藍圖。我很好奇書中是如何將“基於結構”這一核心理念貫穿於“藥物”和“其他生物活性分子”的設計過程中的，這其中的邏輯延展和跨領域整閤令人期待。書中提及的“工具和策略”更是點燃瞭我學習的欲望，我迫切想知道作者們為讀者提供瞭哪些實用的方法論，以及如何將這些工具融會貫通，形成一套行之有效的設計體係。我相信，這本書不僅僅是理論的堆砌，更可能是一份寶貴的實踐指南，能夠幫助那些希望在這個領域有所建樹的研究者們少走彎路，更高效地推進他們的工作。這本書的書名本身就帶著一種前瞻性和指導性，讓我對其中可能包含的創新思維和前沿技術充滿瞭好奇。

評分☆☆☆☆☆

這本書的封麵設計雖然簡約，卻傳遞齣一種嚴謹而專業的學術氛圍。我留意到它涵蓋瞭“藥物”和“其他生物活性分子”的設計，這錶明其討論的範疇相當廣泛，可能不僅僅局限於傳統的藥物化學，而是延伸到瞭更廣泛的生物分子領域，例如天然産物、多肽、核酸甚至功能性蛋白質的設計。我個人非常關注的是書中對於“基於結構”的設計方法的闡述。這意味著它很可能詳細介紹瞭如何利用三維結構信息來指導分子的設計，這通常涉及到分子模擬、對接、虛擬篩選等一係列計算化學和生物信息學的技術。我非常期待書中能夠深入剖析這些技術的原理、應用場景以及它們的局限性。同時，“工具和策略”的字眼也暗示著書中會提供一套係統性的方法論，可能會包含數據分析、算法選擇、實驗驗證等多個環節的指導。我希望這本書能夠提供一些實際的案例研究，展示如何將這些理論工具轉化為具體的分子設計方案，並最終實現預期的生物活性。

評分☆☆☆☆☆

當我看到這本書的名字《基於結構的藥物及其他生物活性分子設計--工具和策略》時，我的腦海中立刻浮現齣各種分子模擬軟件的界麵，以及大量的結構數據。我猜測這本書會深入探討如何利用蛋白質、核酸等生物大分子的三維結構信息，來指導小分子藥物或具有特定功能的生物分子的設計。這其中一定涉及到精密的計算過程，例如分子動力學模擬、量子化學計算、以及各種對接和篩選算法。我非常想知道，書中是如何將這些復雜的理論和技術，以一種易於理解的方式呈現給讀者。更重要的是，它所提及的“策略”是否能為我提供一套清晰的設計思路？我是否能從中學習到如何從一個生物靶點齣發，一步步地設計齣具有所需活性的分子？此外，“其他生物活性分子”的涵蓋範圍是否廣泛，例如是否包括多肽、核酸適配體，甚至是一些非天然氨基酸構建的功能性蛋白？這些都讓我對書中的內容充滿無限的遐想。

評分☆☆☆☆☆

這本書的書名一下子就抓住瞭我的興趣點。我一直在關注藥物研發領域，尤其是利用結構信息進行藥物設計的新方法。而“其他生物活性分子”的加入，讓這本書的吸引力更上一層樓。我非常好奇，作者們是如何將“基於結構”的設計理念，應用到一些非傳統藥物的分子設計中去的。例如，是否涉及到設計具有特定功能的酶、信號分子，甚至是用於生物傳感器或診斷試劑的分子？我非常期待書中能夠提供一些這方麵的案例分析，展示這些設計的思路和流程。同時，書中提到的“工具和策略”也讓我對它充滿瞭期望。我希望它能詳細介紹一些常用的計算化學軟件、數據庫，以及一些創新性的算法和方法。我更希望它能提供一套完整的“工作流程”，能夠指導我在實際研究中，如何從確定靶點到最終得到有潛力的分子。這本書對我來說，不僅僅是一本參考書，更可能是一次學習新知識、掌握新技能的契機。

評分☆☆☆☆☆

坦白說，我購買這本書的初衷，是希望能夠找到一個清晰的路徑，來理解和掌握“基於結構”的分子設計這一復雜領域。從書名來看，它似乎做到瞭這一點。我尤其對“其他生物活性分子”的設計這一部分感到好奇，因為我一直認為，許多新穎的生物活性分子，並不一定是通過傳統的藥物開發路徑誕生的，它們可能來源於天然産物、甚至是通過基因工程或閤成生物學技術構建的。這本書是否能夠提供一套通用的設計框架，能夠適用於不同類型的生物活性分子，這一點對我來說至關重要。書中提到的“工具和策略”也讓我對接下來的學習充滿瞭期待。我希望它能介紹一些最新的計算化學軟件、數據庫資源，以及一些創新的設計理念和算法。如果書中能夠包含一些具體的實踐操作指南，例如如何構建分子庫、如何進行活性預測、如何優化分子結構等，那就更完美瞭。我期待這本書能夠成為我進行分子設計研究時的得力助手。