编辑推荐
适读人群 :本书适合从事基因芯片技术应用的科研人员以及综合性大学、医学院校生命科学专业本科生和研究生使用。 本书由国内专家撰写,内容较精要,配图较多,系统性和实用性较强。
内容简介
基因芯片利用微电子、微机械、生物化学、分子生物学、新型材料、计算机和统计学等多学科的先进技术,实现了在生命科学研究中样品处理、检测和分析过程的连续化、集成化和微型化,为生命科学研究,医学,药物研究与开发,法医鉴定,工农业以及食品与环境卫生监督等领域,乃至整个人类社会带来广泛而深刻的变革。
全书除了介绍基因芯片的基本原理外,重点综合了国内外基因芯片领域的新进展,全面系统介绍了不同基因芯片的原料选择、制备、样品标记和处理、质量控制、实验设计、实验过程以及仪器设备使用、芯片扫描和数据分析方法等,并介绍了芯片实验过程中的故障排除和在各个领域中的广泛应用。编写中突出实用性,对实验过程和数据分析重点详细介绍,既介绍方法,也有操作步骤,对实验过程中应注意的问题也做出了详细的分析,并用了较大篇幅介绍了芯片实验的质量控制,可操作性强。
本书旨在为从事基因芯片应用的科研人员和研究生提供全面、实用的芯片原理和操作参考手册,适合从事基因芯片技术应用的科研人员以及综合性大学、医学院校生命科学专业本科生和研究生使用。
作者简介
马文丽,国家二级教授、博士生导师。现任南方医科大学基因工程研究所所长,华南生物芯片研究中心主任;广东省生物化学与分子生物学学会副理事长;中国生物化学与分子生物学学会理事。
基因芯片技术近年来发展迅速,可解决早期、高通量同步检测多个基因的难题,从而达到早期分子诊断的目的。然而该技术在实际应用中仍然存在三大技术瓶颈(基因探针制备、样品荧光标记及杂交检测)。马文丽教授针对上述三大关键技术进行了系统深入的自主创新性研究,取得了创新性成果。申请了11项国家专利,其中8项国家发明专利、3项实用新型专利已获得授权,建立了生物芯片高新技术平台。
目录
第一章 基因芯片分析技术简介 / 001
第一节 基因芯片分析原理 / 002
第二节 基因芯片技术的应用 / 002
第三节 基因表达谱分析 / 004
第四节 基因组分析中的基因芯片技术 / 008
第五节 基因芯片技术在新药研发领域的应用 / 009
本章小结 / 010
参考文献 / 011
第二章 基因芯片制备的相关材料 / 013
第一节 合成寡聚核苷酸片段制备基因芯片 / 014
第二节 用于质量控制的靶序列 / 016
第三节 其他生物芯片的原料 / 018
本章小结 / 022
参考文献 / 022
第三章 基因芯片的制备过程 / 024
第一节 芯片制备技术总论 / 025
第二节 基因芯片原位合成技术 / 025
第三节 基因芯片打印技术 / 028
第四节 组织芯片制造技术 / 031
第五节 纳米技术在芯片制造中的应用 / 033
第六节 电磁基因芯片的制备过程 / 034
本章小结 / 035
参考文献 / 035
第四章 基因芯片杂交样品的荧光标记技术 / 036
第一节 荧光素的分类 / 037
第二节 常用荧光标记物的化学原理 / 039
第三节 荧光标记的过程 / 043
本章小结 / 050
参考文献 / 050
第五章 样品的处理过程 / 052
第一节 RNA的纯化过程 / 052
第二节 RNA分子降解的防范 / 055
第三节 RNA提取方法的选择 / 056
第四节 纯化RNA的鉴定 / 076
第五节 样品准备过程中的注意事项 / 080
本章小结 / 083
参考文献 / 083
第六章 用于基因表达谱分析的待测样品标记 / 085
第一节 转录序列的成分分析 / 085
第二节 RNA标记方法的选择 / 089
第三节 RNA标记过程 / 091
第四节 酶介导的标记过程 / 094
第五节 cDNA反转录过程中的标记过程 / 096
第六节 转录后cDNA的标记 / 097
第七节 RNA扩增标记过程 / 097
第八节 基因表达谱的代表性 / 099
第九节 随机引物标记过程 / 103
第十节 直接法化学标记过程 / 105
第十一节 标记后的样品纯化 / 106
第十二节 标记后纯化试剂盒的选择 / 108
本章小结 / 111
参考文献 / 112
第七章 标记探针的质控 / 113
第一节 用于标记探针质控的色谱技术 / 113
第二节 标记核酸的定量计算 / 119
第三节 标记探针的纯化 / 121
第四节 标记待杂交样品的质控分析 / 123
本章小结 / 124
参考文献 / 124
第八章 基因芯片杂交过程 / 125
第一节 基因芯片杂交过程概述 / 125
第二节 预杂交过程 / 126
第三节 芯片的分子杂交 / 127
第四节 杂交后清洗的严谨度控制 / 132
第五节 基因芯片片基与杂交后清洗 / 133
本章小结 / 141
第九章 杂交过程中仪器的使用 / 143
第一节 杂交炉 / 143
第二节 常用杂交炉的选择 / 145
第三节 杂交过程的监测 / 150
本章小结 / 152
第十章 用于杂交信息检测的基因芯片荧光扫描仪系统 / 153
第一节 基因芯片荧光扫描仪的原理 / 154
第二节 扫描系统的构建 / 155
第三节 激发光光源 / 156
第四节 发射光的收集 / 159
第五节 信号检测与放大 / 161
第六节 系统工作效率的确定 / 163
第七节 荧光与波长滤片的选择及其基本原理 / 165
第八节 常用基因芯片扫描仪 / 169
本章小结 / 171
第十一章 基因芯片实验的设计与数据分析 / 172
第一节 基因芯片实验设计 / 172
第二节 基因芯片数据分析原理 / 177
第三节 基因芯片杂交图像的分析 / 198
第四节 芯片实验过程中的对照设计 / 201
第五节 基因芯片数据分析常用数据库与软件 / 202
本章小结 / 210
第十二章 基因芯片实验故障排除指南 / 211
第一节 基因芯片实验系统的优化 / 212
第二节 基因芯片实验的设计与实施 / 216
第三节 基因芯片数据分析 / 221
本章小结 / 227
参考文献 / 228
第十三章 基因芯片发展大事记 / 229
第一节 膜基因微阵列的出现 / 229
第二节 原位显微光蚀刻与原位合成技术 / 230
第三节 纳米技术与基因芯片技术 / 232
第四节 组织芯片技术的发展 / 233
第五节 电子基因芯片的可能 / 234
第六节 基因芯片技术的临床应用 / 235
第七节 基因芯片技术在基因测序中的应用 / 236
第八节 基因芯片的应用前景 / 237
参考文献 / 238
前言/序言
随着人类基因组计划的完成,生命科学已进入全基因组和大数据时代。2015年2月国家成立中国精准医疗战略专家组,标志着我国精准医疗事业迈入新的发展纪元。基因芯片技术作为生命科学与医学研究的重要手段,必将为阐明生命的本质、揭示生命之谜,发挥重要的作用。
基因芯片技术融合了生物学、微电子学、生物信息学等众多学科,经过20余年的不断发展,已经在各个学科发挥了重要的作用,并且取得了令人振奋的研究成果。它不仅是学科交叉融合的典范,更是研究生命奥秘的极好工具,成为国内外众多学者与企业家们关注的焦点。
目前,国内系统介绍该技术的基本原理和方法方面的书籍不多,我们在本书中结合自己在基因芯片研究方面的经验,同时参考新的文献资料,对基因芯片的基本理论、实验方法与操作规程及其在基因表达分析与基因组研究、基因突变检测与多态性分析等方面的应用进行了系统的阐述。本书将使读者对这一技术有更加详细的认识和了解,希望能为生命科学领域中从事教学与科研工作的高校教师、科研院所的研究人员、博士生、硕士生等提供有益的帮助。本书可以作为基因芯片操作和实验的参考书。
在本书的编写过程中,化学工业出版社给予了大力支持和帮助,在此深表感谢。由于基因芯片技术涉及广泛、发展迅速、更新快,书中在理论与方法阐述以及名词概念的表述上难免存在不足之处,欢迎读者批评、指正,提出宝贵意见。
编 者
2016年3月于广州
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