第1章 计算机与化学
1.1 计算机与化学
1.1.1 计算机化学
1.1.2 计算化学
1.1.3 理论化学
1.1.4 量子化学
1.2 计算机化学的发展
1.3 我国计算(机)化学的发展概况
1.4 分子模拟与量化计算简介
1.4.1 分子模拟的意义
1.4.2 分子模拟的一般过程
1.4.3 分子模型的构建
1.4.4 分子模拟的方法
1.5 常用化学软件简介
1.5.1 化学图文设计软件
1.5.2 计算化学与分子模拟软件
1.5.3 化学数据库
1.5.4 图谱解析软件
1.5.5 数据处理软件
1.5.6 文献管理软件
1.6 计算化学应用
1.7 计算机化学的学习方法
1.8 相关网站及参考书
第2章 ChemSketch的使用
2.1 ChemSketch概述
2.1.1 主要功能
2.1.2 软件界面
2.2 结构模式
2.2.1 常用工具与快捷按钮
2.2.2 基本操作
2.2.3 高级操作
2.2.4 二维优化
2.2.5 三维优化
2.2.6 模板的应用
2.2.7 模板的管理
2.3 绘图模式
2.3.1 常用工具与快捷按钮
2.3.2 反应能量图
2.3.3 原子轨道图
2.3.4 实验装置图
2.4 分子性质的预测
第3章 ChemBioDraw的使用
3.1 ChemBioDraw概述
3.1.1 版本介绍
3.1.2 运行系统要求
3.1.3 新特性
3.2 ChemBioDraw工具栏与文档
3.2.1 工具栏与窗口显示
3.2.2 文档操作
3.2.3 页面设置
3.3 ChemBioDraw操作实例
3.3.1 画丙酮分子
3.3.2 使用环工具
3.3.3 画反应式
3.3.4 画中间体
3.3.5 使用碎片工具
3.3.6 画多点配位结构
3.3.7 费歇尔投影式
3.3.8 画透视图
3.3.9 画纽曼投影式
3.3.10 使用立体化学标记
3.3.11 使用模板
3.4 结构式的基本画法
3.4.1 选择对象
3.4.2 化学键
3.4.3 环
3.4.4 脂肪链
3.4.5 画DNA、RNA序列
3.4.6 展开标签与压缩标签
3.4.7 说明文本与原子标注
3.5 结构式的高级技法
3.5.1 连接对象
3.5.2 组合对象
3.5.3 反映结构
3.5.4 整理结构
3.5.5 原子编号
3.5.6 使用模板
3.5.7 定义别名
3.5.8 三维预览
3.6 查询结构
3.6.1 原子属性
3.6.2 键属性
3.6.3 通用别名
3.6.4 列表元素
3.6.5 聚合物表示法
3.6.6 替换基团
3.6.7 展开查询结构
3.6.8 反应映射图
3.7 结构与性质
3.7.1 检查结构
3.7.2 分析窗口
3.7.3 估算化学性质
3.7.4 体化学性质
3.7.5 化学计量网格
3.7.6 从结构到命名
3.7.7 从命名到结构
3.7.8 估算NMR的化学位移
3.8 绘图工具的使用
3.8.1 轨道工具
3.8.2 化学符号工具
3.8.3 箭头与曲线工具
3.8.4 基本绘图工具
3.8.5 括号工具
3.8.6 TLC工具
3.8.7 生物绘图工具
第4章 ChemBio3D的使用
4.1 ChemBio3D简介
4.1.1 版本介绍
4.1.2 量化程序接口
4.1.3 新特性
4.2 ChemBio3D基础
4.2.1 ChemBio3D主界面
4.2.2 菜单命令
4.2.3 工具栏
4.3 ChemBio3D实例
4.3.1 熟悉ChemDraw面板
4.3.2 使用画键工具和旋转工具
4.3.3 使用文本工具
4.3.4 分析乙烷的构象
4.3.5 使用二面角驱动器
4.3.6 重叠模型
4.3.7 对接模型
4.3.8 HOMO和LUMO轨道
4.3.9 绘制表面图
4.3.10 局部电荷
4.4 模型的创建
4.4.1 设置构建模型的选项
4.4.2 使用键工具建模
4.4.3 使用ChemDraw面板
4.4.4 使用文本工具建模
4.4.5 使用坐标表建模
4.4.6 模型坐标
4.4.7 参数表与测量表
4.5 模型的修改
4.5.1 选择对象
4.5.2 改变元素
4.5.3 改变键级
4.5.4 添加分子碎片
4.5.5 使用测量表
4.5.6 设置电荷
4.5.7 原子编号
4.5.8 改变立体化学构型
4.5.9 优化模型
4.5.10 显示和隐藏原子
4.5.11 移动模型
4.5.12 旋转模型
4.5.13 改变模型大小
4.6 模型的显示
4.6.1 结构显示
4.6.2 分子表面显示
4.6.3 弹出信息
4.6.4 查看测量表
4.6.5 查看原子属性表
4.6.6 查看分子内坐标表
4.6.7 查看笛卡儿坐标表
4.6.8 模型浏览器
4.6.9 结构浏览器
4.6.10 偏离平面
4.7 模型的输出
4.7.1 打印与保存
4.7.2 复制与封装
4.8 分子模拟入门
4.8.1 计算方法概述
4.8.2 分子力学理论
4.8.3 分子动力学模拟
4.9 MOPAC计算接口
4.9.1 计算实例
4.9.2 能量最小化
4.9.3 优化到过渡态
4.9.4 选择方法
4.9.5 计算性质
4.9.6 文件管理
4.10 Gaussian计算接口
4.10.1 Gaussian接口
4.10.2 能量最小化计算
4.10.3 优化到过渡态
4.10.4 计算性质
4.10.5 创建输入文件
4.10.6 运行输入文件
4.10.7 查看输出结果
第5章 Gaussian的使用
5.1 Gaussian概述
5.1.1 软、硬件要求
5.1.2 硬盘分区方案
5.1.3 安装软件
5.1.4 指定Scratch文件目录
5.1.5 设置内存和硬盘空间
5.1.6 Gaussian03的链接
5.2 启动Gaussian程序
5.2.1 启动程序
5.2.2 工作环境初始化设置
5.3 创建Gaussian输入文件
5.3.1 使用GO3W创建
5.3.2 使用ChemBio3D创建
5.3.3 使用GaussView创建
5.3.4 使用文本编辑器
5.4 执行Gaussian计算作业
5.4.1 在GO3w中运行
5.4.2 在ChemBio3D中运行
5.4.3 在GaussView中运行
5.5 查看Gaussian计算结果
5.5.1 用文本编辑器查看
5.5.2 用GaussView显示分子的振光谱和NMR谱
5.5.3 用HyperChem进行简振模式分析
5.5.4 用ChemBio3D显示计算结果
5.6 运用Gaussian的基本技巧
5.6.1 [Utilities]菜单命
5.6.2 配合使用的辅助软件
5.6.3 辅助软件联用
5.7 Gaussian应用实例
5.7.1 单点能计算
5.7.2 几何优化
5.7.3 频率计算
5.7.4 高精度计算
5.7.5 化学反应研究
5.7.6 激发态计算
5.7.7 溶液中的反应
第6章 GaussView的使用
6.1 GaussView基础
6.1.1 分子集、模型和视图
6.1.2 菜单命令与工具栏
6.1.3 GaussView参数选择
6.2 构建分子
6.2.1 使用工具面板
6.2.2 构建分子实例
6.2.3 查看与调整结构参数
6.2.4 高级构建功能
6.3 显示与保存分子视图
6.3.1 管理分子视图
6.3.2 文件操作
6.3.3 打印及保存图片
6.3.4 指定默认文件位置
6.4 创建Gaussian作业
6.4.1 计算设置面板
6,4.2 设置特殊任务
6.4.3 为作业设置默认值
6.4.4 快速运行作业
6.4.5 观察和控制计算
6.4.6 指定如何运行CO3w
6.5 查看Gaussian结果
6.5.1 显示结果数据摘要
6.5.2 显示原子电荷
6.5.3 显示表面和等高线
6.5.4 显示振动模式及光谱
6.5.5 显示NMR光谱
6.5.6 显示紫外可见光谱
6.5.7 查看其他图形
附录 能量单位
读完《化学图文设计与分子模拟计算》这本书,我深刻体会到了现代化学研究的魅力。书中将图文设计和分子模拟计算巧妙地融合在一起,为我打开了一个全新的学习视角。过去,我对化学分子的认识,大多停留在书本上的二维图示,感觉非常抽象。而这本书,通过精美的图文设计,将那些肉眼看不见的分子,生动地呈现在我眼前,让我能够直观地理解它们的结构和性质。更让我惊喜的是,它还介绍了分子模拟计算的应用。我可以通过计算机模拟,去“观察”分子的运动,去“预测”化学反应的发生,去“设计”新的分子。这种将理论与实践相结合的学习方式,极大地提升了我学习化学的兴趣和效率。
评分我一直认为,化学是一门“看得见”的科学,但过去的学习经历,却让我觉得它“看不见”。直到我翻开《化学图文设计与分子模拟计算》这本书,我才真正体会到这句话的含义。书中对于分子结构的可视化设计,简直是艺术品级别的。每一个原子,每一个键,都经过精心设计,色彩搭配和谐,比例精准,仿佛在进行一场视觉盛宴。更让我惊叹的是,它还将分子模拟计算的结果,用如此清晰直观的方式展现出来。我能够看到分子在不同能量状态下的形变,能够观察到反应过程中能量的传递,甚至能够预测一些化学反应的发生概率。这种将抽象的计算数据,转化为生动图像的能力,极大地激发了我进一步探索化学世界的兴趣。
评分这本书的书名是《化学图文设计与分子模拟计算》,读完之后,我最大的感受就是,它像是一扇打开了新世界大门的钥匙,让我对化学这门学科的理解,从二维的文字描述,跃升到了三维的动态想象。之前,我学习化学,总是在脑海里勾勒出那些抽象的分子式和反应方程式,但总感觉隔靴搔痒,无法真正触碰到它们的灵魂。这本书,恰恰弥补了这一遗憾。它用精美的图文,将复杂的化学结构生动地呈现在我眼前,不仅仅是静态的图片,更有动态的模拟过程,让我能够清晰地看到原子间的键如何形成,电子云是如何分布,反应是如何发生的。这种直观的视觉冲击,比任何枯燥的文字描述都来得更加深刻和持久。
评分这本书的书名,一开始就吸引了我,《化学图文设计与分子模拟计算》。我一直觉得,化学的美,不仅仅在于它的理论,更在于它的形态和动态。而这本书,完美地结合了这两者。书中的图文设计,可以说是达到了教科书级别的水准,每一张图片都经过精心制作,既有科学的严谨性,又不失艺术的美感。而分子模拟计算的部分,更是将化学研究的尖端技术,以一种易于理解的方式呈现给读者。我看到了如何利用计算模拟来预测分子的性质,如何设计新的材料,如何优化反应条件。这种将理论知识与实践应用相结合的方式,让我对化学的认识,上升到了一个新的高度。
评分作为一名对化学充满好奇的学习者,我一直在寻找能够帮助我深入理解化学原理的工具。《化学图文设计与分子模拟计算》这本书,无疑就是我一直寻觅的宝藏。它不仅仅是一本介绍化学知识的书,更是一本关于如何“看”化学的书。书中大量的图示,将原本晦涩难懂的化学概念,变得一目了然。那些复杂的分子结构,那些微观的反应过程,都被巧妙地用图像语言表达出来。而分子模拟计算的部分,更是让我大开眼界。我从来没有想过,通过计算机,我竟然能够“亲身”参与到化学分子的构筑和反应中,观察它们的动态变化,预测它们的性质。这种互动式的学习体验,让我对化学的热情,如同燎原之火,一发不可收拾。
评分第1章 计算机与化学
评分一般般的书,在正式出版的书中算好的了。不过还是去网上找一些手册教程,会详细的多
评分还可以,送来的不慢。
评分计算机及网络技术的应用现已深入到化学研究的各个领域,使传统化学研究的手段和方法发生了深刻的变化。如今的化学研究已由纯实验科学,演变为先实验再计算、边实验边计算,直至成为先理论计算再实验验证、实验研究与理论计算相结合的全新科学研究模式,逐步形成了专门研究计算机技术在化学及其相关领域中应用的分支学科——计算机化学与化学模拟。
评分还不错!!!!!!!
评分化学图文设计与分子模拟计算,上课用
评分很好用的东东,没什么缺点
评分这本书还不错哦,推荐~
评分性价比很高 还可以,和印象里的有一点点区别,可能是我记错了书比我想的要厚很多,就是字有点小,不过挺实惠的,很满意!书非常好,正版的,非常值,快递也给力,必须给好评,就是感觉包装有点简陋啊哈哈~~~不过书很好,看了下内容也都很不错,快递也很给力,东西很好 物流速度也很快,和照片描述的也一样,给个满分吧 下次还会来买!记得有一次,我独自一人出来逛街。逛了大半天,什么也没有买到,不是东西不合适,就是价格太高,就在我准备两手空空打道回府的时候,无意中发现前方不远处有一个卖小百货的商店,走上前去一看,商店里面正挂着一些极其精致漂亮的背包,那时为了不至于两手空空回去,我总想凑合着买点东西,经过一番讨价还价,便商定了价格,付了钱之后,我正准备拿起我相中的背包离开的时候,无意中发现背包上有一根拉链坏了,于是我又重新挑选了一个,正要转身离开,那店主居然耍赖说我还没有付钱,硬拉着要我付钱,还说什么谁能证明你付了钱呢?没办法,我是自己一个人去的,旁边又没有其它顾客,谁能证明呢?天晓得。我辩不过她,只好愤愤不平地两手空空回去了。从那以后,我吃一堑,长一智,我就常常到网上购物了。在我还没有看这本书的时候,我丝毫不怀疑它是一本好书,很符合80后读者的口味。很难想象一本图书会被我看得像郭德纲的相声书一样,在地铁上都如饥似渴地手不释卷。人都说《红楼梦》是一部罕见的奇书,是人生的镜子,那么对于这部书,在某种意义上也令我感到了丝丝“找出心中所想”的意味,因为我不仅从中看出大论的味道,更是以一种看搞笑图书的心情在愉悦自己,事实上这本书确实不失幽默,在大论了一把之后确实愉悦了广大读者,在此之前,我从来没想过会像一本幽默小说一样去看这本书,因为多年来这类书的泛滥使我对其十分不屑。了解京东:2013年3月30日晚间,京东商城正式将原域名360buy更换为jd,并同步推出名为“joy”的吉祥物形象,其首页也进行了一定程度改版。此外,用户在输入jingdong域名后,网页也自动跳转至jd。对于更换域名,京东方面表示,相对于原域名360buy,新切换的域名jd更符合中国用户语言习惯,简洁明了,使全球消费者都可以方便快捷地访问京东。同时,作为“京东”二字的拼音首字母拼写,jd也更易于和京东品牌产生联想,有利于京东品牌形象的传播和提升。京东在进步,京东越做越大。||||好了,现在给大家介绍两本本好书:《谢谢你离开我》是张小娴在《想念》后时隔两年推出的新散文集。从拿到文稿到把它送到读者面前,几个月的时间,欣喜与不舍交杂。这是张小娴最美的散文。美在每个充满灵性的文字,美在细细道来的倾诉话语。美在作者书写时真实饱满的情绪,更美在打动人心的厚重情感。从装祯到设计前所未有的突破,每个精致跳动的文字,不再只是黑白配,而是有了鲜艳的色彩,首次全彩印刷,法国著名唯美派插画大师,亲绘插图。|两年的等待加最美的文字,就是你面前这本最值得期待的新作。《洗脑术:怎样有逻辑地说服他人》全球最高端隐秘的心理学课程,彻底改变你思维逻辑的头脑风暴。白宫智囊团、美国FBI、全球十大上市公司总裁都在秘密学习!当今世界最高明的思想控制与精神绑架,政治、宗教、信仰给我们的终极启示。全球最高端隐秘的心理学课程,一次彻底改变你思维逻辑的头脑风暴。从国家、宗教信仰的层面透析“思维的真相”。白宫智囊团、美国FBI、全球十大上市公司总裁都在秘密学习!《洗脑术:怎样有逻辑地说服他人》涉及心理学、社会学、神经生物学、医学、犯罪学、传播学适用于:读心、攻心、高端谈判、公关危机、企业管理、情感对话……洗脑是所有公司不愿意承认,却是真实存在的公司潜规则。它不仅普遍存在,而且无孔不入。阅读本书,你将获悉:怎样快速说服别人,让人无条件相信你?如何给人完美的第一印象,培养无法抗拒的个人魅力?如何走进他人的大脑,控制他们的思想?怎样引导他人的情绪,并将你的意志灌输给他们?如何构建一种信仰,为别人造梦?
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