蛋白質組學研究:概念技術及應用 [Proteome Research Concepts,Technology and Application(Second Edition)]

蛋白質組學研究:概念技術及應用 [Proteome Research Concepts,Technology and Application(Second Edition)] pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

[澳大利亞] M.R.威爾金斯,[瑞士] R.D.阿佩爾,[澳大利亞] K.L.威廉斯,[瑞士] D.F.霍赫斯特拉塞爾 著,張麗華,梁振,張玉奎 等 譯
圖書標籤:
  • 蛋白質組學
  • 生物技術
  • 分子生物學
  • 生命科學
  • 蛋白質分析
  • 生物醫學
  • 基因組學
  • 生物信息學
  • 研究方法
  • 應用
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齣版社: 科學齣版社
ISBN:9787030272188
版次:31
商品編碼:11646131
包裝:平裝
叢書名: 生命科學前沿
外文名稱:Proteome Research Concepts,Technology and Application(Second Edition)
開本:16開
齣版時間:2010-05-01
用紙:膠版紙#

具體描述

內容簡介

  在蛋白質組學水平上,對生命活動的功能執行體——蛋白質進行深入係統的研究,不僅有助於全景式地揭示生命活動的本質,而且對於研究疾病機製、發展頂警、診斷和治療方法均具有重要意義。《蛋白質組學研究:概念技術及應用》在綜述蛋白質組學近10年的發展曆程基礎上,探討瞭蛋白質組在樣品預處理、質譜鑒定、定量分析、成像分析、數據處理,相互作用等方麵的技術發展,並介紹瞭蛋白質組學在生物、醫學領域的應用。此外,還對蛋白質組學未來的發展方嚮進行瞭展望。
  《蛋白質組學研究:概念技術及應用》可供生物、醫學、化學、藥學等領域的研究人員參考,也可作為高等院校相關專業本科生和研究生的參考書。

目錄

譯者序
再版序
再版前言

第1章 蛋白質組學的10年
1.1 蛋白質組學導引
1.1.1 蛋白質組學的含義是什麼?
1.1.2 事情是否會有所不同?
1.2 技術推動瞭蛋白質組學的發展
1.2.1 蛋白質分離
1.2.2 質譜分析
1.2.3 數據解析
1.3 蛋白質組學傳達瞭什麼信息?
1.4 什麼尚不清楚?
1.5 本書內容和相關結論
參考文獻

第2章 基於電泳的蛋白質組樣品製備與預分級技術
2.1 引言
2.2 常規的樣品製備
2.3 人為修飾
2.3.1 半胱氨酸的還原與烷基化
2.3.2 半胱氨酸的β-消除
2.3.3 賴氨酸的氨甲酰化
2.4 蛋白質組學的多元化研究方法
2.5 預分級技術
2.5.1 離心分級
2.5.2 色譜技術
2.5.3 電泳技術
2.6 用於樣品預分級的其他方法
2.6.1 高豐度蛋白質的去除
2.6.2 均衡器顆粒
2.7 結論
參考文獻

第3章 蛋白質組學中的蛋白質鑒定
3.1 引言
3.2 蛋白質鑒定中有用的屬性
3.2.1 來源種類
3.2.2 蛋白質等電點
3.2.3 蛋白質分子質量
3.2.4 部分序列或序列標簽
3.2.5 蛋白質氨基酸組成
3.3 蛋白質質譜鑒定技術
3.3.1 用於蛋白質鑒定的top-down和bottom-up策略
3.3.2 MS概述
3.3.3 基於肽質量指紋譜鑒定蛋白質
3.3.4 基於多級質譜的蛋白質鑒定
3.4 工具和網址列錶
3.5 結語
參考文獻

第4章 定量蛋白質組學
第5章 一個基因,多個蛋白質
第6章 蛋臼質組成像技術
第7章 蛋白質組學的數據集成
第8章 蛋白質的相互作用
第9章 蛋白質組學在生物醫學中的應用
第10章 蛋白質組學:下一步在哪裏?
圖版
精準醫學的基石:下一代基因組學與轉錄組學深度解析 本書聚焦於人類健康與疾病研究的前沿領域,全麵涵蓋瞭基因組學、轉錄組學及其在臨床轉化中的最新進展與應用。 第一部分:基因組學基礎與進化 第一章:人類基因組的精細結構與功能元件 本章深入剖析瞭人類基因組的復雜性,從宏觀的染色體結構到微觀的DNA序列特徵。重點探討瞭非編碼DNA(如內含子、著絲粒、端粒)的功能角色,以及它們在基因調控網絡中的關鍵作用。特彆關注瞭重復序列(如轉座子)的動態變化及其對基因組穩定性和進化施加的影響。本章還詳細介紹瞭高分辨率基因組測繪技術(如PacBio SMRT、Oxford Nanopore)如何揭示傳統測序技術無法解析的結構變異,為理解復雜疾病的遺傳基礎提供瞭新的視角。 第二章:單核苷酸多態性(SNP)與疾病易感性 本章係統梳理瞭SNP的發現、分型和關聯研究方法。內容涵蓋瞭全基因組關聯研究(GWAS)的設計原理、數據分析挑戰(如多重檢驗校正、群體結構控製),以及如何通過功能注釋來闡釋GWAS發現的非編碼區SNP的緻病機製。探討瞭稀有變異(Rare Variants)在罕見病和復雜疾病中的獨特貢獻,以及如何利用大規模人群隊列數據來提高這些變異的統計效能。 第三章:錶觀遺傳學:DNA甲基化與組蛋白修飾的動態調控 本章著重於基因組信息錶達層麵的調控機製。詳細闡述瞭DNA甲基化、組蛋白翻譯後修飾(如乙酰化、甲基化、磷酸化)的分子機製及其對染色質可及性的影響。重點介紹瞭用於解析全基因組甲基化圖譜(WGBS、MeDIP-seq)和組蛋白修飾位點(ChIP-seq)的技術流程、數據處理與生物學解讀。同時,探討瞭錶觀遺傳標記在發育過程中的重編程以及在腫瘤發生發展中的異常模式。 第二部分:轉錄組學:從基因錶達到功能網絡 第四章:高通量測序時代的轉錄組學技術 本章全麵介紹瞭當前主流的RNA測序技術。內容從經典的mRNA測序擴展到全長轉錄組測序(Iso-Seq),強調瞭如何通過這些技術精確識彆基因的不同剪接異構體(Splicing Isoforms)。深入解析瞭非編碼RNA(ncRNA)的研究範疇,包括長鏈非編碼RNA(lncRNA)和環狀RNA(circRNA)的鑒定、錶達譜分析及其作為分子調控器的潛在功能。 第五章:單細胞轉錄組學:解析異質性與細胞圖譜構建 本章聚焦於革命性的單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術。詳細介紹瞭微流控平颱(如10x Genomics)的工作原理、數據捕獲效率與偏差分析。重點闡述瞭如何利用降維、聚類分析(如Seurat, Scanpy)來識彆和定義新的細胞亞群,以及如何進行細胞軌跡推斷(Pseudotime Analysis)來模擬連續的細胞分化過程。本書籍特彆收錄瞭空間轉錄組學(Spatial Transcriptomics)的最新進展,展示瞭在組織微環境中解析基因錶達的空間上下文信息。 第六章:轉錄組數據分析的高級統計模型與功能富集 本章提供瞭轉錄組數據差異錶達分析(如DESeq2, edgeR)的深入解讀,並超越瞭簡單的差異基因篩選。內容涵蓋瞭復雜的比較分析,如多組學數據整閤、時間序列分析。深入講解瞭基因本體論(GO)和通路富集分析(KEGG, Reactome)的統計學基礎,並探討瞭利用網絡分析方法來構建和解讀基因調控網絡,識彆關鍵的Hub基因。 第三部分:臨床轉化與前沿應用 第七章:生物信息學基礎設施與數據標準化 本章著眼於支撐基因組學和轉錄組學研究的基礎設施建設。討論瞭大型數據集的管理、存儲(如雲平颱應用)和計算資源優化。詳細介紹瞭數據質量控製(QC)的關鍵指標和標準化的流程,強調瞭數據共享、可重復性研究(Reproducibility)以及符閤FAIR原則(Findable, Accessible, Interoperable, Reusable)的數據管理策略。 第八章:從變異到藥物:基因組學在藥物研發中的角色 本章探討瞭基因組學信息在精準治療中的直接應用。內容包括藥物基因組學(Pharmacogenomics)如何指導特定患者對藥物的反應性預測,以及如何利用基因分型數據來優化藥物劑量和減少不良反應。詳細闡述瞭基於基因組或轉錄組特徵的靶點發現策略,特彆是針對復雜疾病如心血管疾病和神經退行性疾病的遺傳風險評分(PRS)的構建與驗證。 第九章:液體活檢與循環遊離DNA(cfDNA)分析 本章聚焦於非侵入性診斷的前沿技術——液體活檢。深入解析瞭cfDNA和循環腫瘤DNA(ctDNA)的來源、釋放機製及其在癌癥早期篩查、治療反應監測和微小殘留病竈(MRD)檢測中的應用潛力。討論瞭超靈敏的數字PCR(ddPCR)和靶嚮測序技術如何提高ctDNA的檢齣限,並探討瞭該技術在移植醫學(如移植物排斥監測)中的新興應用。 第十章:數據整閤與多組學模型構建 本章總結瞭將基因組、轉錄組與臨床錶型數據進行有效整閤的策略。討論瞭基於機器學習和深度學習模型(如神經網絡)來處理高維生物學數據的優勢。重點介紹瞭如何構建綜閤性的預測模型,以期實現對疾病進展、預後判斷以及治療反應更準確的預測,為推進個體化醫療提供量化工具。 --- 本書的特色: 本書嚴格遵循現代生命科學研究的實際操作流程,從實驗設計、技術原理、數據分析到臨床解讀,提供瞭一個無縫銜接的知識體係。作者群匯集瞭資深生物信息學傢和臨床遺傳學傢,確保瞭內容的嚴謹性、前沿性和實踐指導性。本書旨在為生命科學、醫學、藥學及生物工程領域的研究生、青年研究人員以及緻力於轉化醫學實踐的臨床醫生提供一本全麵而深入的參考指南。

用戶評價

評分

收到這本《蛋白質組學研究:概念技術及應用》第二版,我的第一反應就是它的實用性。我一直認為,一本好的學術專著,不應該僅僅是理論的堆砌,更應該能夠指導實際的研究工作。從書名來看,它顯然是朝著這個方嚮努力的。我特彆希望書中關於“技術”的部分能夠足夠詳盡和更新。例如,在質譜技術日益發展的今天,不同類型的質譜儀在蛋白質組學研究中有何優劣?如何根據不同的研究問題選擇閤適的質譜平颱?數據分析方麵,有哪些最新的算法和軟件可以幫助我們從海量數據中挖掘齣有價值的信息?另外,“應用”部分我也會仔細研讀,希望能看到一些實際的研究案例,比如如何利用蛋白質組學技術開發新型的診斷試劑,或者如何通過蛋白質組學來理解某個復雜生物過程的分子機製。我期待這本書能提供一些“乾貨”,讓我讀完之後,不僅能理解理論,更能動手去實踐,甚至能夠獨立設計和開展蛋白質組學相關的研究項目。

評分

我個人對這本書的期待,更多是它能否提供一個全新的視角來看待生命科學研究。我們都知道,基因是藍圖,RNA是信使,而蛋白質則是真正執行生命活動的執行者。過去,我們可能更多地關注基因層麵的調控,但現在,隨著技術的發展,直接研究蛋白質的組學層麵的信息變得越來越可行。《蛋白質組學研究:概念技術及應用》第二版,我希望它能帶領我深入到蛋白質的宏大世界,理解蛋白質的種類、結構、相互作用以及它們在細胞內外的復雜網絡。我猜想書中會詳細介紹各種高通量蛋白質組學技術,比如如何捕捉、分離、鑒定和定量大量的蛋白質,以及如何分析這些海量數據。更重要的是,我希望這本書能啓發我對蛋白質組學在疾病機製研究中的應用有更深刻的理解。很多疾病的發生發展,都與蛋白質的異常錶達、修飾或功能改變密切相關,如果能通過蛋白質組學手段,找到疾病的生物標誌物,或者揭示新的治療靶點,那將是多麼瞭不起的成就!我期待這本書能提供這樣的啓示和方法論。

評分

這本《蛋白質組學研究:概念技術及應用》第二版,我預感它將成為我書架上最常被翻閱的工具書之一。我之前的學習經曆中,總是感覺蛋白質組學相關的資料要麼過於碎片化,要麼就是深度太過晦澀,難以找到一本能將概念、技術和應用有機整閤起來的佳作。這本書恰好填補瞭這個空白。從“概念”入手,意味著它不會一開始就拋齣技術細節,而是會循序漸進地引導讀者理解蛋白質組學的核心思想和研究範式,這一點對我這樣的初學者來說至關重要。而“技術”部分,我猜想應該涵蓋瞭當前最前沿的分析方法和平颱,無論是定性還是定量,從單細胞到群體,從體內到體外,應該都有涉及。最讓我期待的是“應用”篇章,因為理論學習最終要落地,我希望書中能展示蛋白質組學如何賦能生物醫藥、農業育種、環境保護等多個領域,通過具體的案例研究,展現蛋白質組學研究的強大潛力,激發我的創新思維,讓我思考如何將這些知識運用到我自己的研究方嚮中去。

評分

對於《蛋白質組學研究:概念技術及應用》第二版,我最期待的是它能夠幫助我建立起一套完整的蛋白質組學研究思維框架。我知道蛋白質組學是一個交叉學科,涉及生物學、化學、信息學等多個領域,理解起來並不容易。我希望這本書能夠從最基本的蛋白質組學概念講起,比如蛋白質的結構、功能、修飾等等,然後逐步深入到各種先進的蛋白質組學技術,如質譜、色譜、抗體芯片等,並且詳細介紹這些技術的原理、優缺點以及適用範圍。我尤其關心的是書中關於數據分析的部分,因為蛋白質組學産生的數據量巨大,如何有效地對數據進行挖掘和解讀,是研究成功的關鍵。我希望這本書能提供一些實用的數據分析策略和工具推薦。最後,我希望這本書能在“應用”部分展現蛋白質組學研究的廣闊前景,比如在腫瘤研究、神經科學、微生物學等領域的最新進展,以及如何將蛋白質組學技術應用於藥物開發和生物標誌物發現。總而言之,我希望這本書能夠成為我學習和研究蛋白質組學的得力助手。

評分

我真的迫不及待想翻開這本《蛋白質組學研究:概念技術及應用》第二版!從書名就能感受到它的厚重和專業,對於我這樣一個對蛋白質組學充滿好奇,但又覺得它像座迷宮的讀者來說,這本書簡直是黑夜裏的燈塔。我一直覺得,蛋白質作為生命活動的執行者,它們的世界一定比基因的世界更加波瀾壯闊,也更加難以捉摸。這本書能帶我從最基礎的概念入手,深入淺齣地剖析蛋白質組學到底是什麼,它和基因組學、轉錄組學又有什麼樣的聯係和區彆。那些聽起來就很炫酷的技術,比如質譜、色譜、芯片等等,不知道在這本書裏會以怎樣的形式呈現?是枯燥的原理講解,還是生動的圖文結閤?我特彆期待書中能有一些實際案例的分析,讓我看到這些復雜的技術是如何被應用到具體的科學研究中,解決實際問題的。比如,在疾病診斷、藥物研發、甚至生命起源的研究中,蛋白質組學扮演著怎樣的角色?讀完這本書,我希望我能對蛋白質組學有一個係統、全麵的認識,不再是零散的知識點,而是能夠構建起一個清晰的知識體係,為我今後的學習和研究打下堅實的基礎。

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