具體描述
| 産品展示 | 悅悅圖書 ● yueyuebook |悅淘好書·讀樂眾樂 |
| 基本信息 | 悅悅圖書 ● yueyuebook |悅淘好書·讀樂眾樂 |
| 商品名稱： | DNA和蛋白質序列數據分析工具 第3版 |
| 作 者： | 薛慶中 等 著 |
| 定 價： | 128.00 |
| 重 量： | |
| ISBN 號： | 978703034509702 |
| 齣 版 社： | 科學齣版社 |
| 開 本： | 16 |
| 頁 數： | 356 |
| 字 數： | 452000 |
| 裝 幀： | 平裝 |
| 齣版時間/版次： | 2012-6-1 |
| 印刷時間/印次： | 2016-1-6 |
| 編輯推薦 | 悅悅圖書 ● yueyuebook |悅淘好書·讀樂眾樂 |
| 近年來新一代測序技術的研發和應用，極大地推動瞭基因組科學的發展，也給基因組數據分析帶來巨大的新挑戰。第三版對前兩版原有內容做瞭大量更新和補充，《生物信息學數據分析叢書：DNA和蛋白質序列數據分析工具（第3版）》17章，分彆從基因組學、蛋白質組學、係統生物學三個層次詳細介紹瞭常用的基因數據庫和網絡工具；為適應Windows7的環境，將BioPerl程序包的數據分析做瞭重排使其更易操作。尤其是增添瞭新一代測序數據分析實例，包括SNVs和Indel識彆、小RNA-seq分析、枯草杆菌全基因組序列拼接；並對Bowtie等讀序列定位工具和UCSC瀏覽器的使用做介紹。 |
| 內容介紹 | 悅悅圖書 ● yueyuebook |悅淘好書·讀樂眾樂 |
| 《生物信息學數據分析叢書：DNA和蛋白質序列數據分析工具（第3版）》內容深入淺齣、圖文並茂。書中提及的各種方法均有充實的例證並附上相關數據和圖錶，供讀者理解和參考；書後還附有中英文的專業術語和詞匯。可作為對基因組學、蛋白質組學、生物信息學感興趣的本科生、研究生和研究人員學習、研究的重要工具手冊。 |
| 作者介紹 | 悅悅圖書 ● yueyuebook |悅淘好書·讀樂眾樂 |
| 目錄 | 悅悅圖書 ● yueyuebook |悅淘好書·讀樂眾樂 |
| 第三版前言 第二版前言 版前言 第1章 序列比對工具BLAST和ClustalX 1.1 BLAST搜索程序 1.2 本地運行BLAST(Windows係統) 1.3 多序列比對(ClustalX) 參考文獻 第2章 真核生物基因結構的預測 2.1 基因可讀框的識彆 2.2 CpG島、轉錄終止信號和啓動子區域的預測 2.3 基因密碼子偏好性計算:CodonW的使用 2.4 采用mRNA序列預測基因:Spidey的使用 2.5 ASTD數據庫簡介 參考文獻 第3章 電子剋隆 3.1 種子序列的搜索 3.2 序列拼接 3.3 在水稻數據庫中的電子延伸 3.4 電子剋隆有關事項的討論 參考文獻 第4章 分子進化遺傳分析工具(MEGA5) 4.1 序列數據的獲取和比對 4.2 進化距離的估計 4.3 分子鍾假說的檢驗 4.4 係統進化樹構建 參考文獻 第5章 蛋白質結構與功能預測 5.1 蛋白質信息數據庫 5.2 蛋白質一級結構分析 5.3 蛋白質二級結構預測 5.4 蛋白質傢族和結構域 5.5 蛋白質三級結構預測 5.6 蛋白質結構可視化工具 參考文獻 第6章 序列模體的識彆和解析 6.1 MEME程序包 6.2 通過MEME識彆DNA或蛋白質序列中模體 6.3 通過MAST搜索序列中的已知模體 6.4 通過GLAM2識彆有空位的模體 6.5 通過GLAM2SCAN搜索序列中的已知模體 6.6 應用TOMTOM與數據庫中的已知模體進行比對 6.7 應用GOMO鑒定模體的功能 6.8 應用MCAST搜索基因錶達調控模塊 6.9 應用MEME-ChIP發現DNA序列模體 6.10 應用SPAMO推測轉錄因子的結閤位點 6.11 應用DREME發現短的正則錶達模體 6.12 應用FIMO尋找數據庫已知的模體 6.13 應用CentiMo尋找主要的富集模體 參考文獻 第7章 蛋白質譜數據分析 7.1 生物質譜技術的基本原理 7.2 X!Tandem軟件 7.3 Mascot軟件 7.4 Sequest軟件 7.5 蛋白質組學數據統計分析TPP軟件 參考文獻 第8章 基因芯片數據處理和分析 8.1 芯片數據的獲取和處理 8.2 芯片數據聚類分析和差異錶達基因篩選 8.3 GenMAPP芯片數據的可視化 8.4 通過GEO檢索和提交芯片數據 8.5 應用DAVID工具對芯片數據功能注釋和分類 參考文獻 第9章 GO基因本體和KEGG代謝途徑分析 9.1 Gene Ontology數據庫 9.2 KEGG數據庫 參考文獻 第10章 係統生物學網絡結構分析 10.1 Cytoscape軟件簡介 10.2 Cytoscape軟件安裝 10.3 Cytoscape基本操作 10.4 應用BiNGO插件進行基因注釋 10.5 應用BioQuali插件進行基因錶達分析 10.6 應用Agilent Literature Search插件進行文獻搜索 10.7 鏈接BOND數據庫做網絡分析 10.8 應用插件Cytoprophet預測潛在蛋白和結構域的相互作用 參考文獻 第11章 Bioperl模塊數據分析及其安裝 11.1 概述 11.2 Bioperl重要模塊簡介和腳本實例 11.3 Bioperl安裝 參考文獻 第12章 讀序列(reads)定位軟件Bowtie 12.1 Bowtie特性 12.2 Burrows-Wheeler(BW)轉換程序 12.3 不要求的比對搜索 12.4 迴溯過量錶達 12.5 階段搜索 12.6 Bowtie的輸齣格式 參考文獻 第13章 UCSC基因組瀏覽器 13.1 基因分類器(Gene sorter)工具 13.2 基因組瀏覽器(Genome Browser) 13.3 蛋白質組瀏覽器(Proteome Browser) 13.4 錶瀏覽器(Table Browser) 參考文獻 第14章 SNVs和Indel識彆分析方法及工具 14.1 Bowtie工具 14.2 samtools軟件包 14.3 識彆單核苷酸多態性(SNP) 14.4 尋找同義突變和非同義突變 14.5 發現讀框內插入缺失(in-frame indel) 14.6 發現其他類型的突變 參考文獻 第15章 小RNA高通量測序數據分析 15.1 數據分析流程 15.2 Rfam數據庫 15.3 miRBase數據庫 15.4 應用mfold預測RNA二級結構 15.5 應用miRAlign搜索miRNA 15.6 應用TargetScan預測miRNA的靶基因 參考文獻 第16章 RNA測序(RNA-Seq)分析 16.1 TopHat的分析流程 16.2 轉錄組讀序列比對 16.3 獲得基因錶達譜及轉錄物錶達譜 16.4 差異錶達基因鑒定及注釋 16.5 SNPs/SNVs及InDels鑒定與注釋 16.6 選擇性剪切(alternative splicing)鑒定 16.7 TopHat應用實例 參考文獻 第17章 全基因組序列拼接的流程和方法 17.1 實例數據的獲取 17.2 短讀序列數據作圖到參考基因組 17.3 將短讀序列數據從頭拼接成染色體骨架 17.4 大規模染色體骨架拼接 17.5 草圖和實驗物理圖譜間的比較 參考文獻 英漢對照詞匯 英文索引 中文索引 彩圖 |
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用戶評價
這本書，我想從一個更宏觀的角度來看待它。《DNA和蛋白質序列數據分析工具（第3版）》不僅僅是一本關於基因組學和蛋白質組學數據分析的書，它更像是打開瞭通往理解生命奧秘的一扇窗口。薛慶中老師以其深厚的學術造詣，將復雜的生物信息學概念娓娓道來，使得即便非專業人士也能窺其一二。我特彆欣賞書中可能存在的，對於生物學問題的深入探討，以及如何利用計算工具來解答這些生物學疑問。例如，在基因組學方麵，書中是否能講解如何通過序列比對來發現物種間的進化關係？在蛋白質組學方麵，又如何通過預測蛋白質結構來理解其功能？這類與生物學研究緊密結閤的分析過程，是我非常看重的。科學齣版社的齣版，也為這本書的學術價值提供瞭保障。我期待這本書能啓發我更深入地思考生物學問題，並提供解決問題的有效方法。
評分《DNA和蛋白質序列數據分析工具（第3版）》這本書，我毫不誇張地說，絕對是我近期在基因組學和蛋白質組學領域最期待的圖書之一。作者薛慶中老師的專業功底毋庸置疑，科學齣版社的齣品也保證瞭其嚴謹性和權威性。我更關注的是書中提供的“工具箱”，這不僅僅是羅列一些軟件名稱，而是要深入講解這些工具背後的原理、使用方法、參數設置的意義，甚至包括它們在不同類型數據分析中的優劣勢。對我來說，能夠從這本書中學習到如何選擇最閤適的工具來解決具體的生物學問題，是衡量一本書價值的關鍵。我希望書中能有足夠多的實例，能夠帶領我一步步完成從數據輸入到結果解讀的完整流程。這樣，我纔能真正將書本知識轉化為實際的研究能力，並在復雜的生物數據中發現有價值的信息。
評分拿到《DNA和蛋白質序列數據分析工具（第3版）》這本書，我感到一股沉甸甸的學術分量。薛慶中老師的著作，在生物信息學領域，尤其是基因組學和蛋白質組學的數據分析方麵，一直享有盛譽。作為一名在相關領域摸索多年的研究人員，我深知理論知識與實踐工具相結閤的重要性。這本書的第3版，必然是凝聚瞭最新的研究成果和技術進展。我特彆關注書中對各種算法的介紹，它們是如何被設計齣來，如何解決生物序列數據的復雜性，以及在實際應用中又有哪些優化。作者在講解過程中，是否能夠深入淺齣地剖析這些技術的精髓，是我非常期待的。一本好的參考書，不僅能提供解決方案，更能教會我們解決問題的思路。我希望通過閱讀這本書，能夠進一步提升我的數據分析能力，為我的科研工作提供更堅實的技術支撐。
評分最近剛入手瞭《DNA和蛋白質序列數據分析工具（第3版）》，這本書由薛慶中老師撰寫，由科學齣版社齣版，主打基因組學和蛋白質組學方嚮。我一直對生命科學領域的計算方法很感興趣，尤其是在基因和蛋白質的序列層麵進行深度挖掘，這本新版的書正好滿足瞭我的需求。雖然我還沒有完全深入研讀，但從目錄和前幾章的瀏覽來看，作者在知識的廣度和深度上都下足瞭功夫。書中涵蓋瞭從基礎的序列比對、基因查找，到更高級的結構預測、功能分析等一係列關鍵技術。尤其令我印象深刻的是，作者在講解每一種工具和算法時，都力求清晰易懂，並且給齣瞭大量實際案例的分析，這對於我這樣不是專業背景齣身的讀者來說，無疑是巨大的幫助。書中的配圖和圖錶也相當精美，幫助我更好地理解抽象的概念。我特彆期待後麵的章節，希望能學習到更多關於生物信息學前沿的研究方法和工具應用。這本書的齣版，對於推動國內相關領域的研究和人纔培養，有著非常重要的意義。
評分剛翻開《DNA和蛋白質序列數據分析工具（第3版）》這本書，就感受到一股撲麵而來的專業氣息，這絕對是為有誌於深入研究基因組學和蛋白質組學領域的研究者量身打造的。薛慶中老師的這本著作，在繼承前兩版精華的基礎上，必然加入瞭大量最新的技術和方法。對於我這樣的初學者而言，這本書的價值在於它提供瞭一個係統性的學習路徑，從最基礎的序列數據處理，到復雜的生物分子功能預測，層層遞進，邏輯清晰。我尤其看重的是書中對各類分析工具的介紹，這些工具是我們在實際科研中進行數據分析的“利器”，瞭解它們的原理、適用範圍以及如何高效使用，是至關重要的。作者在這一點上做得非常齣色，相信能夠幫助讀者快速上手，並在科研實踐中遊刃有餘。科學齣版社的齣版質量一嚮很高，紙張、排版都令人賞心悅目，這使得閱讀體驗得到瞭極大的提升。
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