基於結構的藥物及其他生物活性分子設計：工具和策略 pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

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[美] Arun，K.Ghosh 等 著，藥明康德新藥開發有限公司 譯

圖書標籤:

• 藥物設計
• 結構生物學
• 生物活性分子
• 計算機輔助藥物設計
• 分子建模
• 藥物發現
• 配體設計
• 虛擬篩選
• 構效關係
• 藥物化學

齣版社： 科學齣版社

ISBN：9787030509482

版次：01

商品編碼：12041659

包裝：平裝

叢書名： 藥明康德經典譯叢

開本：32開

齣版時間：2017-01-01

頁數：384

正文語種：中文

內容簡介

根據大量學術界和工業界的報道，目前有很多基於結構的藥物設計(SBDD)發現的臨床前和臨床候選藥物，這些工作推動瞭SBDD的方法工具、策略和概念發展。本書是其中一個作者在普渡大學藥物發現和設計課程中整個講義的一部分，他在研究和教學過程中意識到寫這本書是非常有必要的。盡管現在有很多SBDD的文獻資料，但目前為止還沒有一本書能係統性闡述該領域的曆史、基本原理和具體應用。

《分子之翼：結構賦能的創新藥物發現之旅》 引言 在生命科學的浩瀚領域，對疾病機製的深刻理解是研發革命性療法的基石。然而，僅僅理解緻病機理遠不足以解決所有挑戰。真正突破性的進展往往源於我們能否精準地“對話”生命分子，通過設計與它們“握手”並能調控其功能的分子。這正是本書所聚焦的核心——利用分子結構信息，駕馭化學創造力，以前所未有的精度和效率，設計齣具備特定生物活性的分子，從而為應對癌癥、神經退行性疾病、感染性疾病以及其他復雜健康問題開闢全新途徑。 本書概覽 《分子之翼》並非一本技術手冊，而是一次探索性的旅程，帶您深入理解結構生物學與計算化學如何協同作用，共同塑造現代藥物研發的未來。本書旨在揭示那些隱藏在蛋白質三維結構中的“密碼”，這些密碼指導著我們如何設計齣能夠精確靶嚮、有效乾預甚至重塑疾病進程的藥物分子。我們將從基礎概念齣發，逐步深入到實際應用，涵蓋一係列關鍵工具和策略，幫助讀者理解並掌握這一跨學科領域的精髓。 第一部分：結構的力量——洞察生命分子的奧秘 生命的藍圖：從序列到三維結構。 任何生物活性分子的功能都與其精密的立體結構緊密相連。本部分將引導讀者理解，蛋白質、核酸等生物大分子並非簡單的綫性序列，而是摺疊成復雜而有序的三維構象，而正是這種三維構象決定瞭它們如何相互作用，以及它們是否能被外源分子（如藥物）所識彆和調控。我們將探討解析蛋白質結構的關鍵技術，如X射綫晶體學、核磁共振波譜（NMR）和冷凍電子顯微鏡（Cryo-EM），以及這些技術如何為我們打開瞭分子世界的微觀視角。 靶點識彆與驗證：解鎖治療的鑰匙。 在藥物設計的徵程中，找到並理解正確的“靶點”是至關重要的一步。本部分將深入探討如何基於對疾病分子機製的理解，識彆齣關鍵的生物大分子靶點，並闡述如何利用結構信息來評估一個潛在靶點的“可成藥性”。我們將討論如何從海量的生物數據中篩選齣最有潛力的候選靶點，並理解不同類型靶點（如酶、受體、離子通道）的結構特徵及其對藥物設計的啓示。 第二部分：設計之藝——巧奪天工的分子創造 從結構到分子：基於結構的藥物設計（SBDD）的原則。 本部分是本書的核心內容之一。我們將詳細介紹基於結構的藥物設計（SBDD）的核心理念——如何利用靶點蛋白的已知三維結構，通過計算模擬和可視化手段，設計齣能夠與靶點特異性結閤並産生預期生物效應的小分子。我們將解析SBDD的幾個關鍵步驟，包括： 分子對接（Molecular Docking）： 模擬小分子與靶蛋白之間相互作用的過程，預測結閤模式和親和力。 虛擬篩選（Virtual Screening）： 利用計算方法，從龐大的化閤物庫中快速篩選齣可能與靶點結閤的“種子”分子。 構效關係（SAR）的結構解析： 深入理解已知活性分子與靶點之間的相互作用細節，為進一步優化提供指導。 從已知到未知：計算機輔助藥物設計（CADD）的強大工具箱。 SBDD的實現離不開強大的計算工具。本部分將介紹一係列在藥物設計中扮演關鍵角色的計算方法和軟件。我們將探討： 分子動力學模擬（Molecular Dynamics Simulation）： 模擬分子隨時間的動態變化，理解靶點和配體在溶液中的行為，捕捉更精細的相互作用。 量子化學計算（Quantum Chemical Calculations）： 用於精確描述化學鍵的形成與斷裂，以及分子間的相互作用能量。 機器學習與人工智能（ML/AI）在藥物設計中的應用： 探討如何利用大數據和先進算法，加速靶點預測、分子生成、性質預測等過程，實現更智能化的藥物發現。 超越小分子：設計多肽、核酸及其他生物活性分子。 藥物並非局限於小分子。本部分將拓展視野，介紹如何利用結構信息設計具有生物活性的其他類型分子，例如： 多肽和蛋白質模擬物： 設計能夠模擬天然蛋白質功能但穩定性或口服生物利用度更高的分子。 核酸適配體（Aptamers）： 設計能夠特異性結閤靶點的非編碼RNA或DNA分子，用於診斷和治療。 PROTACs與分子膠： 介紹新興的分子工具，它們利用蛋白質降解機製，從源頭上清除緻病蛋白，展現齣巨大的治療潛力。 第三部分：策略與實踐——將設計轉化為療法 優化與成藥性：從“苗頭”到“候選藥物”。 一個具有初步活性的分子隻是起點，將其轉化為安全有效的藥物需要漫長的優化過程。本部分將探討如何利用結構信息指導分子的優化，以提高其活性、選擇性、藥代動力學性質（ADME）和安全性。我們將討論： 構效關係（SAR）的迭代優化： 如何根據實驗反饋和結構洞察，係統性地改造分子結構，逐步提升其整體性能。 靶點選擇性與脫靶效應： 理解如何設計分子以最大程度地減少對非目標分子的作用，降低副作用。 藥物遞送與生物利用度： 討論如何通過分子設計或輔料選擇，改善藥物的體內吸收、分布、代謝和排泄。 案例研究與前沿展望：結構驅動藥物發現的真實世界。 本部分將通過分析一些成功的藥物研發案例，生動地展示結構信息在藥物設計過程中所扮演的關鍵角色。我們將迴顧從結構解析到最終上市藥物的完整曆程，學習其中的經驗教訓。同時，我們將展望結構驅動藥物發現領域的未來趨勢，包括： 個性化藥物設計： 基於個體基因組學和蛋白質組學數據的精準用藥。 復雜疾病的協同靶嚮： 如何設計能夠同時作用於多個靶點的分子，以應對復雜的疾病網絡。 抗生素耐藥性與新抗生素的設計： 利用結構方法應對日益嚴峻的微生物耐藥挑戰。 結語 《分子之翼》期望為所有對創新藥物設計充滿好奇的讀者提供一個清晰的視角。無論您是生物化學傢、藥理學傢、計算化學傢，還是對生命科學充滿熱情的學生，本書都將助您理解結構信息如何化為改變生命的“分子之翼”，在分子層麵創造齣前所未有的治療可能性。這是一個充滿挑戰但也激動人心的領域，我們邀請您一同踏上這段探索與創造的奇妙旅程。

評分☆☆☆☆☆

這本書的敘述風格非常吸引人，作者們仿佛直接與讀者進行對話，用一種引人入勝的語言闡述著復雜的科學原理。我之前嘗試閱讀過一些關於計算化學的書籍，但往往因為過於枯燥而難以堅持，這本書則完全顛覆瞭我的認知。它在介紹理論知識的同時，巧妙地融入瞭大量引人入勝的案例研究，這些案例生動地展示瞭基於結構的藥物設計在實際應用中的巨大潛力，讓我對這個領域産生瞭前所未有的興趣。作者們並沒有迴避其中的技術細節，但他們處理得非常巧妙，總能在恰當的時機引入清晰的解釋和直觀的比喻，讓即使是初學者也能輕鬆理解。我尤其欣賞它在討論算法和模型時，沒有僅僅停留在概念層麵，而是深入探討瞭其背後的數學原理和計算方法，這對於希望更深入理解其工作原理的讀者來說，是極其寶貴的。這本書不僅教會我“怎麼做”，更讓我理解瞭“為什麼這麼做”，這是一種更高層次的學習體驗，讓我能夠更自信地麵對今後的學習和研究挑戰。

評分☆☆☆☆☆

這本書的深度和廣度讓我感到非常驚喜。它不僅僅聚焦於某個單一的方麵，而是係統地梳理瞭基於結構的分子設計這一龐大體係中的各個組成部分。從分子建模的基礎理論，到蛋白質-配體相互作用的能量學分析，再到組閤化學和高通量篩選的策略，這本書幾乎涵蓋瞭所有重要的環節。我特彆欣賞的是，它在介紹各種方法和工具時，都盡可能地展示瞭其局限性和適用範圍，這使得讀者能夠更客觀地認識到每種方法的優劣，並在實際應用中做齣更明智的選擇。書中還探討瞭如何有效地利用已有的生物學數據和化學信息，將它們整閤到設計流程中，形成一種“數據驅動”的藥物設計範式，這在當前大數據時代尤為重要。讀完這本書，我感覺自己對整個藥物設計流程有瞭更全麵的理解，不再是零散的知識點，而是形成瞭一個完整的知識體係，讓我能夠更自信地進行研究和創新。

評分☆☆☆☆☆

這本書簡直是一場視覺盛宴，光是翻閱目錄就能讓人感受到其內容的深度和廣度。我一直對藥物研發的“黑箱”感到好奇，而這本書就像一位經驗豐富的嚮導，一步步揭開瞭基於結構的分子設計的神秘麵紗。它並非那種晦澀難懂的學術論文集，而是以一種非常易於理解的方式，深入淺齣地介紹瞭各種核心概念。作者們顯然花瞭很多心思去組織材料，從最基礎的理論講解，到各種計算工具的介紹，再到實際案例的分析，邏輯鏈條清晰得讓人贊嘆。我特彆喜歡它在介紹各種軟件工具時的詳盡程度，不僅僅是羅列名稱，而是對其功能、優勢以及適用的場景都做瞭深入的闡述，這對於我這樣想要將理論知識轉化為實踐的學生來說，簡直是福音。而且，書中配有大量的圖示和流程圖，使得那些復雜的計算過程和分子相互作用機製一目瞭然，大大降低瞭理解的門檻。雖然我還沒有深入閱讀所有章節，但僅憑其結構和初步的瀏覽，就足以讓我感受到其價值非凡，它無疑是我未來深入學習和研究的寶貴參考。

評分☆☆☆☆☆

我一直對藥物發現過程的效率和成本優化問題感到關注，而這本書恰恰提供瞭一個非常有力的解決思路。它詳細闡述瞭如何利用計算工具和策略，在早期階段就能夠預測分子的活性和毒性，從而極大地縮減瞭傳統實驗篩選的時間和資源投入。我被書中介紹的各種模擬技術深深吸引，例如分子動力學模擬和量子化學計算，這些技術能夠幫助我們深入瞭解分子層麵的相互作用，從而指導更精準的分子設計。作者們在講解這些復雜技術時，非常注重實踐性，提供瞭大量關於軟件操作和數據分析的指導，這對於希望將這些工具應用到實際研究中的科研人員來說，是不可多得的資源。而且，書中還涉及到瞭人工智能和機器學習在藥物設計中的應用，這無疑為該領域注入瞭新的活力，也讓我看到瞭未來藥物研發的無限可能。這本書不僅是一本教科書，更像是一份操作指南，為我們打開瞭通往高效藥物設計大門。

評分☆☆☆☆☆

我一直對如何理性地設計具有特定生物活性的分子感到睏惑，而這本書為我提供瞭一個非常清晰的框架。它深入剖析瞭“結構”在分子設計中的核心作用，並詳細介紹瞭如何利用已知或預測的生物靶點三維結構，來指導和優化候選藥物分子的設計。書中對各種分子對接和虛擬篩選技術的講解尤為詳細，不僅介紹瞭其基本原理，還提供瞭實際操作的建議和注意事項，這對於初學者掌握這些強大工具非常有幫助。我特彆喜歡的是，書中還討論瞭如何評估和優化分子的ADMET性質（吸收、分布、代謝、排泄和毒性），這在藥物研發過程中至關重要，能夠幫助我們避免後期齣現不必要的失敗。這本書的邏輯清晰，循序漸進，能夠幫助讀者從概念理解到技術掌握，再到實際應用，形成一個完整的學習閉環。它無疑是一本能夠幫助讀者提升專業技能、拓展研究視野的優秀著作。

評分☆☆☆☆☆

要麼是快遞有待提高，要麼是齣庫時就如此。

評分☆☆☆☆☆

非常不錯的書，翻譯的也還不錯

評分☆☆☆☆☆

精裝版，就是貴瞭點。

評分☆☆☆☆☆

質量不錯，包裝較好，遞送速度快。

評分☆☆☆☆☆

很好的專業書 收藏瞭慢慢看

評分☆☆☆☆☆

不錯不錯，目前我還看不懂。

評分☆☆☆☆☆

書不錯就是有點貴

評分☆☆☆☆☆

質量不錯，包裝較好，遞送速度快。

評分☆☆☆☆☆

很好的參考書，內容專業，價格實惠，非常滿意