華大基因國傢基因庫係列：生物信息數據庫建設、使用與管理指南 pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

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張勇，嚴誌祥，魏曉峰 等 編

圖書標籤:

• 生物信息學
• 基因庫
• 數據庫
• 數據管理
• 生物數據庫
• 華大基因
• 國傢基因庫
• 指南
• 生物技術
• 數據分析

齣版社： 科學齣版社

ISBN：9787030418005

版次：1

商品編碼：11560693

包裝：精裝

叢書名： 華大基因國傢基因庫係列

開本：16開

齣版時間：2014-10-01

用紙：膠版紙

頁數：290

正文語種：中文

內容簡介

　　《華大基因國傢基因庫係列：生物信息數據庫建設、使用與管理指南》先從整體上對國內外生物信息數據庫進行整體的概述。從數據來源、數據類型、生物數據分析方法、生物信息分析平颱等方麵探討如何對生物數據庫的數據進行管理，包括數據采集、數據存儲、備份和恢復等。然後介紹瞭數據庫設計的方法、原則及常見生物信息數據庫的特點並以NCBI為例介紹瞭數據庫如何提交數據、檢索數據等。最後探討瞭數據庫的倫理學及知識産權保護問題。

目錄

前言第一篇 生物信息數據庫概述1 生物信息數據庫1.1 生物信息數據庫概述1.2 生物信息數據庫的分類2 國內外生物信息數據庫的發展2.1 國際生物信息數據庫的發展2.2 中國的生物信息數據庫建設2.3 建設生物信息數據庫：存在的問題和解決思路探討
第二篇 用於建立生物信息數據庫的數據管理3 數據來源3.1 從各種生物信息數據庫的FTP下載3.2 各種生物信息數據庫的查詢結果3.3 各實驗終端提供的數據4 數據類型4.1 原始數據4.2 生物信息分析數據5 生物信息分析平颱5.1 生物信息分析平颱簡介5.2 Galaxv平颱5.3 GenePattel—n生物分析平颱5.4 DNAnexus生物分析平颱5.5 Blast forneKP Project6 數據質量管理規範6.1 數據質量概述6.2 生物數據的質量控製7 數據存儲管理7.1 存儲內容7.2 大數據存儲7.3 存儲方式7.4 存儲管理一般原則8 數據備份和恢復管理規範8.1 數據的備份8.2 數據的恢復9 數據安全管理規範9.1 數據分類9.2 權限管理9.3 注意事項
第三篇 建立生物信息數據庫的實用指南10 概述10.1 引言10.2 數據相關的基本概念11 數據庫設計11.1 數據庫設計過程11.2 數據庫設計規範（以關係數據庫為例）11.3 數據庫命名規範12 常見生物信息數據庫特點12.1 數據模型12.2 數據庫的存儲13 生物信息數據庫係統開發13.1 虛擬本地數據庫13.2 本地數據庫
第四篇 生物信息數據庫的使用管理規範14 數據庫的安全性管理14.1 安全性的類型14.2 數據庫安全性控製方法14.3 基於角色訪問控製的安全性和權限管理15 數據提交管理15.1 概述15.2 提交內容15.3 提交方式16 數據共享和交互17 數據檢索17.1 檢索工具17.2 檢索結果格式j
第五篇 倫理學問題18 國際倫理法則19 生物大數據中的倫理問題20 國內生物信息數據庫中的倫理問題21 倫理規範21.1 倫理的原則21.2 關於知情同意22 倫理審查建設22.1 公開透明的政策和社會廣泛參與22.2 信息的處理（保密和告知研究結果）應以參與者利益為重22.3 建立有效的監督和責任機製22.4 加強倫理審查能力建設
第六篇 生物信息數據庫知識産權保護23 引言24 國內外數據庫權利保護相關條約、協議24.1 歐盟數據庫法律保護24.2 美國數據庫法律保護24.3 WIP0數據庫法律保護24.4 我國數據庫法律保護現狀25 生物信息數據庫的保護模式探討25.1 存在的問題25.2 生物信息數據庫知識産權保護建議
參考文獻縮略語錶名詞術語

前言/序言

好的，這是一份關於“華大基因國傢基因庫係列：生物信息數據庫建設、使用與管理指南”的圖書簡介，其中不包含該書的任何具體內容，旨在描繪一個相關但截然不同的主題領域。 --- 圖書簡介：深空探索的遺産——行星地質學與係外宜居性評估 導言：遙遠世界的呼喚與岩石的低語 宇宙的尺度令人敬畏，而人類對生命起源的追問從未停止。本書並非聚焦於地球上的微觀生命藍圖，而是將視野投嚮廣袤的太陽係乃至更遠的星係。它是一部關於行星地質學、天體生物學前沿與係外行星宜居性評估的綜閤性著作。我們探討的不是如何構建和維護數字信息結構，而是如何解讀那些億萬年前被凝固在冰封山脈和熔岩平原上的岩石記錄，從而解碼宇宙中生命存在的可能性。 第一部分：行星的創生與演化：地質過程的宇宙視角 本書的第一部分，將我們帶入行星係統的形成初期。它詳盡論述瞭在原行星盤（Protoplanetary Disk）中，物質如何通過吸積和碰撞過程，逐步凝聚成我們所見的行星體。 1.1 行星內部結構與動力學： 我們深入剖析瞭不同質量天體的核心-地幔-地殼結構。對於類地行星（如火星、金星）而言，熱對流、磁場生成機製及其對大氣演化的長期影響是核心議題。書中詳細對比瞭地球、金星和火星在闆塊構造活動上的差異，並探討瞭失去內部熱源對一個天體地質活動和錶麵環境的毀滅性後果。 1.2 火山活動與岩漿作用： 火山噴發是行星錶麵物質循環的關鍵驅動力。本部分詳述瞭不同重力與大氣壓力條件下，岩漿的粘度和噴發模式如何塑造地貌。我們考察瞭太陽係中主要的火山活動區域，從木衛一（Io）的硫磺噴泉到水星上古老的熔岩海，旨在建立一個普適的岩漿活動模型，以解釋行星錶麵的年齡分期。 1.3 撞擊曆史與錶麵測年： 撞擊事件是行星演化早期不可避免的“消毒劑”。本書提供瞭先進的撞擊坑計數與形態分析方法，用於精確測定不同行星錶麵岩石圈的絕對年齡。我們探討瞭大型撞擊如何誘發全球性的地質災變，以及這些事件如何影響早期生命萌芽（如果存在）的存續機會。 第二部分：水與大氣：宜居性的關鍵要素 生命，至少是我們所知的生命，需要液態水和適宜的溫度範圍。本書的第二部分聚焦於水在太陽係中的“生命周期”及其對行星宜居性的貢獻與挑戰。 2.1 冰下海洋的物理化學： 探索瞭類木行星的冰封衛星（如木衛二歐羅巴、土衛二恩剋拉多斯）的內部結構。我們研究瞭潮汐加熱如何維持冰層下的液態水海洋，並討論瞭深海熱液噴口——可能提供能量和化學物質的“避難所”——的形成機製與化學特徵。 2.2 大氣逃逸與氣候演化： 評估一個行星維持大氣層所需的最小質量和磁場強度。書中運用輻射傳輸模型，模擬瞭不同恒星光譜下，行星大氣層如何受高能粒子輻射剝離，並重點分析瞭地球“失控的溫室效應”——金星——的演化路徑，以期為係外行星的氣候穩定邊界提供參考。 2.3 錶麵礦物學與生物印記的初步篩選： 介紹如何通過遠程光譜學方法，識彆行星錶麵存在特定礦物組閤（如粘土礦物、硫酸鹽等），這些礦物通常是液態水長期作用的産物。雖然本書不涉及生命檢測的復雜生物化學，但它為未來任務設計瞭關鍵的“地質先決條件”篩選流程。 第三部分：係外行星的狩獵場：宜居性指數的構建與挑戰 本書的第三部分將視角擴展到太陽係之外，關注如何利用最新的天文觀測數據來評估遙遠恒星周圍行星的潛在宜居性。 3.1 恒星類型對行星宜居性的影響： 紅矮星（M型星）是銀河係中最常見的恒星，但它們高能耀斑對近距離行星的威脅是巨大的。本章對比瞭G型主序星（如太陽）與M型星周圍的“宜居帶”，分析瞭潮汐鎖定效應和恒星風暴活動對行星氣候的復雜影響。 3.2 係外行星數據分析方法： 介紹瞭開普勒（Kepler）和TESS任務獲取的淩星數據處理基礎，特彆是如何從光變麯綫中反演齣行星的大小、軌道周期以及初步的質量估計。重點討論瞭針對不同類型係外行星（超級地球、迷你海王星）的物理模型選擇。 3.3 宜居性評估模型（HZI）： 提齣瞭一個多參數的行星宜居性指數（Habitability Zone Index, HZI），該指數綜閤考慮瞭行星質量、軌道離心率、恒星輻射強度、大氣逃逸概率以及是否存在地質活動的可能性。本書強調，一個高HZI值並不等同於“已發現生命”，而僅僅意味著該世界在物理和化學上具備維持生命所需的基本環境。 結語：探索的哲學與未來任務展望 本書以對科學探索精神的緻敬收尾。地質學是對時間的解讀，而天體生物學是對位置的追問。我們相信，通過理解岩石的語言和大氣層的呼吸，人類終將能定位到那些最有可能承載生命的“藍點”。未來的任務，如詹姆斯·韋伯太空望遠鏡（JWST）對係外行星大氣的深入分析，以及未來對火星和冰封衛星的就位探測，將是檢驗本書所建立的行星地質學與宜居性理論的終極試驗場。 本書適閤對象： 對行星科學、天體物理學、地質學、以及廣義天體生物學前沿研究感興趣的專業人士、研究生及高年級本科生。它提供瞭一個從宏觀宇宙尺度到微觀岩石結構解析的完整知識框架，完全獨立於任何特定生物信息學或基因數據管理領域的研究範疇。

評分☆☆☆☆☆

這本書的齣版，對於中國乃至全球的生物信息學基礎設施建設，都具有裏程碑式的意義。作為一名在生物技術領域工作多年的資深研究員，我曾參與過一些小型數據庫的搭建工作，也深知其中的不易。但是，與國傢基因庫這樣規模宏大、數據體量龐巨的項目相比，我們所做的隻是冰山一角。《華大基因國傢基因庫係列：生物信息數據庫建設、使用與管理指南》這本書，毫無保留地分享瞭華大基因在這一偉大工程中的寶貴經驗和技術積纍。它不僅僅是關於如何“建”，更是關於如何“用”和“管”。書中對於數據安全、隱私保護、知識産權等方麵的深入探討，以及如何建立有效的協作機製和標準化的工作流程，都展現瞭國傢級基因庫建設的復雜性和前瞻性。我印象深刻的是關於數據生命周期管理中，如何處理海量數據歸檔、版本控製以及數據質量保障的章節，這些都是我們在日常研究中常常遇到的瓶頸。這本書為我們提供瞭係統性的解決方案，也為其他國傢和地區建設類似的生物信息基礎設施提供瞭重要的參考。

評分☆☆☆☆☆

自從接觸到《華大基因國傢基因庫係列：生物信息數據庫建設、使用與管理指南》這本書，我感覺自己對生物信息學領域，尤其是數據管理這一塊的理解，上升到瞭一個全新的高度。我從事的是生物醫藥研發工作，數據是我們的核心資産，但如何高效地組織、存儲、檢索和利用這些數據，一直是我們的痛點。《華大基因國傢基因庫係列：生物信息數據庫建設、使用與管理指南》這本書，就像為我們量身定製的指南。它沒有那些艱澀難懂的專業術語，而是從實際應用的角度齣發，詳細講解瞭如何構建一個滿足科研需求的生物信息數據庫。書中關於數據庫的選型、架構設計、數據集成、以及如何實現數據共享和安全訪問的章節，都提供瞭非常實用的建議。我尤其欣賞書中關於如何利用現有工具和技術，優化數據庫性能，降低維護成本的探討。這些內容對於我們這樣的中小型研發機構來說，非常有價值，能夠幫助我們更有效地管理數據，加速研發進程。讀完這本書，我充滿瞭信心，也對未來生物信息數據管理的發展方嚮有瞭更清晰的認識。

評分☆☆☆☆☆

我是一名有著多年生物信息分析經驗的從業者，日常工作中經常需要與各種生物信息數據庫打交道，也曾遇到過一些關於數據庫維護和更新的棘手問題。坦白說，在閱讀《華大基因國傢基因庫係列：生物信息數據庫建設、使用與管理指南》之前，我對於“建設”和“管理”這兩個環節的理解更多停留在“知道有這麼迴事”的層麵，並沒有深入探索過其背後的技術細節和管理策略。這本書的齣現，徹底改變瞭我的看法。它不僅僅是一本技術手冊，更是一本關於如何係統性思考和執行數據庫項目的哲學指南。書中對於數據庫的生命周期管理，從需求分析、規劃設計，到實施部署、持續優化，都有著非常深刻的見解。我特彆欣賞其中關於數據質量控製和安全性保障的部分，這往往是我們在日常工作中容易忽視但又至關重要的一環。作者們通過大量的圖錶和流程圖，將復雜的概念可視化，使得我能夠輕鬆理解數據一緻性、完整性、可用性等關鍵指標的實現方式。此外，書中還探討瞭如何利用最新的技術手段，如雲計算、容器化等，來提升數據庫的可擴展性和性能，這對我來說是極大的啓發，也讓我看到瞭未來生物信息數據庫發展的新方嚮。

評分☆☆☆☆☆

作為一個非生物信息學背景，但對基因組學研究充滿好奇的科學愛好者，我一直渴望能夠更深入地瞭解支撐這些前沿研究的底層技術。《華大基因國傢基因庫係列：生物信息數據庫建設、使用與管理指南》這本書，意外地成為瞭我跨入這個領域的一扇絕佳窗口。雖然我不是專業的數據庫工程師，但書中對生物信息數據庫的介紹，從其基本概念、重要性，到它在基因組學研究中的具體應用，都寫得非常易懂。我特彆喜歡書中關於數據標準化和互操作性的討論，這讓我理解瞭為什麼不同的數據庫之間能夠相互連接，實現數據的共享和集成。作者們用瞭很多形象的比喻，將抽象的技術概念解釋得生動有趣，讓我即使在沒有深厚專業知識的情況下，也能感受到生物信息數據庫的魅力和價值。讀完這本書，我不再僅僅是關注最終的研究成果，而是開始理解到，每一個偉大的科學發現背後，都有著強大而復雜的數據庫係統在默默支撐。這本書讓我看到瞭科技的嚴謹和力量，也激發瞭我繼續探索生物信息學其他方麵的興趣。

評分☆☆☆☆☆

這本書絕對是生物信息學領域的一本寶藏！作為一個剛開始涉足這個領域的研究生，我被市麵上琳琅滿目的資料弄得眼花繚亂，總覺得找不到一個清晰、係統性的切入點。直到我偶然發現瞭這本《華大基因國傢基因庫係列：生物信息數據庫建設、使用與管理指南》，簡直像是找到瞭指路的明燈。書中的內容沒有絲毫的空洞，而是聚焦於生物信息數據庫這一核心環節，詳盡地闡述瞭如何從零開始構建一個功能完善的數據庫，以及在使用和管理過程中可能遇到的各種挑戰和解決方案。特彆是關於數據庫設計原則、數據模型選擇、以及如何進行高效的數據存儲和檢索的部分，講解得非常透徹，讓我能夠快速理解其中的邏輯和方法。作者們並沒有僅僅停留在理論層麵，而是結閤瞭華大基因在國傢基因庫建設中的實際經驗，分享瞭大量寶貴的實踐案例和技巧。這些案例不僅僅是成功的經驗，也包括瞭他們是如何剋服睏難、解決問題的，這對於我們這些初學者來說，無疑是極大的鼓舞和藉鑒。讀完之後，我感覺自己對於生物信息數據庫的整體框架有瞭非常清晰的認知，並且躍躍欲試想要開始自己的數據庫項目。

評分☆☆☆☆☆

書外錶不錯，有空再讀

評分☆☆☆☆☆

不錯的內容，印刷精美，專業！

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不怎麼樣，彩色的。內容太簡單

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書外錶不錯，有空再讀

評分☆☆☆☆☆

質量很好，內容豐富。

評分☆☆☆☆☆

質量很好，內容豐富。

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這本書很有參考價值，質量也不錯。

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書外錶不錯，有空再讀

評分☆☆☆☆☆

好