华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南 pdf epub mobi txt 电子书 下载 2025

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张勇，严志祥，魏晓峰 等 编

图书标签:

• 生物信息学
• 基因库
• 数据库
• 数据管理
• 生物数据库
• 华大基因
• 国家基因库
• 指南
• 生物技术
• 数据分析

出版社： 科学出版社

ISBN：9787030418005

版次：1

商品编码：11560693

包装：精装

丛书名： 华大基因国家基因库系列

开本：16开

出版时间：2014-10-01

用纸：胶版纸

页数：290

正文语种：中文

内容简介

　　《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》先从整体上对国内外生物信息数据库进行整体的概述。从数据来源、数据类型、生物数据分析方法、生物信息分析平台等方面探讨如何对生物数据库的数据进行管理，包括数据采集、数据存储、备份和恢复等。然后介绍了数据库设计的方法、原则及常见生物信息数据库的特点并以NCBI为例介绍了数据库如何提交数据、检索数据等。最后探讨了数据库的伦理学及知识产权保护问题。

目录

前言第一篇 生物信息数据库概述1 生物信息数据库1.1 生物信息数据库概述1.2 生物信息数据库的分类2 国内外生物信息数据库的发展2.1 国际生物信息数据库的发展2.2 中国的生物信息数据库建设2.3 建设生物信息数据库：存在的问题和解决思路探讨
第二篇 用于建立生物信息数据库的数据管理3 数据来源3.1 从各种生物信息数据库的FTP下载3.2 各种生物信息数据库的查询结果3.3 各实验终端提供的数据4 数据类型4.1 原始数据4.2 生物信息分析数据5 生物信息分析平台5.1 生物信息分析平台简介5.2 Galaxv平台5.3 GenePattel—n生物分析平台5.4 DNAnexus生物分析平台5.5 Blast forneKP Project6 数据质量管理规范6.1 数据质量概述6.2 生物数据的质量控制7 数据存储管理7.1 存储内容7.2 大数据存储7.3 存储方式7.4 存储管理一般原则8 数据备份和恢复管理规范8.1 数据的备份8.2 数据的恢复9 数据安全管理规范9.1 数据分类9.2 权限管理9.3 注意事项
第三篇 建立生物信息数据库的实用指南10 概述10.1 引言10.2 数据相关的基本概念11 数据库设计11.1 数据库设计过程11.2 数据库设计规范（以关系数据库为例）11.3 数据库命名规范12 常见生物信息数据库特点12.1 数据模型12.2 数据库的存储13 生物信息数据库系统开发13.1 虚拟本地数据库13.2 本地数据库
第四篇 生物信息数据库的使用管理规范14 数据库的安全性管理14.1 安全性的类型14.2 数据库安全性控制方法14.3 基于角色访问控制的安全性和权限管理15 数据提交管理15.1 概述15.2 提交内容15.3 提交方式16 数据共享和交互17 数据检索17.1 检索工具17.2 检索结果格式j
第五篇 伦理学问题18 国际伦理法则19 生物大数据中的伦理问题20 国内生物信息数据库中的伦理问题21 伦理规范21.1 伦理的原则21.2 关于知情同意22 伦理审查建设22.1 公开透明的政策和社会广泛参与22.2 信息的处理（保密和告知研究结果）应以参与者利益为重22.3 建立有效的监督和责任机制22.4 加强伦理审查能力建设
第六篇 生物信息数据库知识产权保护23 引言24 国内外数据库权利保护相关条约、协议24.1 欧盟数据库法律保护24.2 美国数据库法律保护24.3 WIP0数据库法律保护24.4 我国数据库法律保护现状25 生物信息数据库的保护模式探讨25.1 存在的问题25.2 生物信息数据库知识产权保护建议
参考文献缩略语表名词术语

前言/序言

好的，这是一份关于“华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南”的图书简介，其中不包含该书的任何具体内容，旨在描绘一个相关但截然不同的主题领域。 --- 图书简介：深空探索的遗产——行星地质学与系外宜居性评估 导言：遥远世界的呼唤与岩石的低语 宇宙的尺度令人敬畏，而人类对生命起源的追问从未停止。本书并非聚焦于地球上的微观生命蓝图，而是将视野投向广袤的太阳系乃至更远的星系。它是一部关于行星地质学、天体生物学前沿与系外行星宜居性评估的综合性著作。我们探讨的不是如何构建和维护数字信息结构，而是如何解读那些亿万年前被凝固在冰封山脉和熔岩平原上的岩石记录，从而解码宇宙中生命存在的可能性。 第一部分：行星的创生与演化：地质过程的宇宙视角 本书的第一部分，将我们带入行星系统的形成初期。它详尽论述了在原行星盘（Protoplanetary Disk）中，物质如何通过吸积和碰撞过程，逐步凝聚成我们所见的行星体。 1.1 行星内部结构与动力学： 我们深入剖析了不同质量天体的核心-地幔-地壳结构。对于类地行星（如火星、金星）而言，热对流、磁场生成机制及其对大气演化的长期影响是核心议题。书中详细对比了地球、金星和火星在板块构造活动上的差异，并探讨了失去内部热源对一个天体地质活动和表面环境的毁灭性后果。 1.2 火山活动与岩浆作用： 火山喷发是行星表面物质循环的关键驱动力。本部分详述了不同重力与大气压力条件下，岩浆的粘度和喷发模式如何塑造地貌。我们考察了太阳系中主要的火山活动区域，从木卫一（Io）的硫磺喷泉到水星上古老的熔岩海，旨在建立一个普适的岩浆活动模型，以解释行星表面的年龄分期。 1.3 撞击历史与表面测年： 撞击事件是行星演化早期不可避免的“消毒剂”。本书提供了先进的撞击坑计数与形态分析方法，用于精确测定不同行星表面岩石圈的绝对年龄。我们探讨了大型撞击如何诱发全球性的地质灾变，以及这些事件如何影响早期生命萌芽（如果存在）的存续机会。 第二部分：水与大气：宜居性的关键要素 生命，至少是我们所知的生命，需要液态水和适宜的温度范围。本书的第二部分聚焦于水在太阳系中的“生命周期”及其对行星宜居性的贡献与挑战。 2.1 冰下海洋的物理化学： 探索了类木行星的冰封卫星（如木卫二欧罗巴、土卫二恩克拉多斯）的内部结构。我们研究了潮汐加热如何维持冰层下的液态水海洋，并讨论了深海热液喷口——可能提供能量和化学物质的“避难所”——的形成机制与化学特征。 2.2 大气逃逸与气候演化： 评估一个行星维持大气层所需的最小质量和磁场强度。书中运用辐射传输模型，模拟了不同恒星光谱下，行星大气层如何受高能粒子辐射剥离，并重点分析了地球“失控的温室效应”——金星——的演化路径，以期为系外行星的气候稳定边界提供参考。 2.3 表面矿物学与生物印记的初步筛选： 介绍如何通过远程光谱学方法，识别行星表面存在特定矿物组合（如粘土矿物、硫酸盐等），这些矿物通常是液态水长期作用的产物。虽然本书不涉及生命检测的复杂生物化学，但它为未来任务设计了关键的“地质先决条件”筛选流程。 第三部分：系外行星的狩猎场：宜居性指数的构建与挑战 本书的第三部分将视角扩展到太阳系之外，关注如何利用最新的天文观测数据来评估遥远恒星周围行星的潜在宜居性。 3.1 恒星类型对行星宜居性的影响： 红矮星（M型星）是银河系中最常见的恒星，但它们高能耀斑对近距离行星的威胁是巨大的。本章对比了G型主序星（如太阳）与M型星周围的“宜居带”，分析了潮汐锁定效应和恒星风暴活动对行星气候的复杂影响。 3.2 系外行星数据分析方法： 介绍了开普勒（Kepler）和TESS任务获取的凌星数据处理基础，特别是如何从光变曲线中反演出行星的大小、轨道周期以及初步的质量估计。重点讨论了针对不同类型系外行星（超级地球、迷你海王星）的物理模型选择。 3.3 宜居性评估模型（HZI）： 提出了一个多参数的行星宜居性指数（Habitability Zone Index, HZI），该指数综合考虑了行星质量、轨道离心率、恒星辐射强度、大气逃逸概率以及是否存在地质活动的可能性。本书强调，一个高HZI值并不等同于“已发现生命”，而仅仅意味着该世界在物理和化学上具备维持生命所需的基本环境。 结语：探索的哲学与未来任务展望 本书以对科学探索精神的致敬收尾。地质学是对时间的解读，而天体生物学是对位置的追问。我们相信，通过理解岩石的语言和大气层的呼吸，人类终将能定位到那些最有可能承载生命的“蓝点”。未来的任务，如詹姆斯·韦伯太空望远镜（JWST）对系外行星大气的深入分析，以及未来对火星和冰封卫星的就位探测，将是检验本书所建立的行星地质学与宜居性理论的终极试验场。 本书适合对象： 对行星科学、天体物理学、地质学、以及广义天体生物学前沿研究感兴趣的专业人士、研究生及高年级本科生。它提供了一个从宏观宇宙尺度到微观岩石结构解析的完整知识框架，完全独立于任何特定生物信息学或基因数据管理领域的研究范畴。

评分☆☆☆☆☆

这本书的出版，对于中国乃至全球的生物信息学基础设施建设，都具有里程碑式的意义。作为一名在生物技术领域工作多年的资深研究员，我曾参与过一些小型数据库的搭建工作，也深知其中的不易。但是，与国家基因库这样规模宏大、数据体量庞巨的项目相比，我们所做的只是冰山一角。《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》这本书，毫无保留地分享了华大基因在这一伟大工程中的宝贵经验和技术积累。它不仅仅是关于如何“建”，更是关于如何“用”和“管”。书中对于数据安全、隐私保护、知识产权等方面的深入探讨，以及如何建立有效的协作机制和标准化的工作流程，都展现了国家级基因库建设的复杂性和前瞻性。我印象深刻的是关于数据生命周期管理中，如何处理海量数据归档、版本控制以及数据质量保障的章节，这些都是我们在日常研究中常常遇到的瓶颈。这本书为我们提供了系统性的解决方案，也为其他国家和地区建设类似的生物信息基础设施提供了重要的参考。

评分☆☆☆☆☆

这本书绝对是生物信息学领域的一本宝藏！作为一个刚开始涉足这个领域的研究生，我被市面上琳琅满目的资料弄得眼花缭乱，总觉得找不到一个清晰、系统性的切入点。直到我偶然发现了这本《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》，简直像是找到了指路的明灯。书中的内容没有丝毫的空洞，而是聚焦于生物信息数据库这一核心环节，详尽地阐述了如何从零开始构建一个功能完善的数据库，以及在使用和管理过程中可能遇到的各种挑战和解决方案。特别是关于数据库设计原则、数据模型选择、以及如何进行高效的数据存储和检索的部分，讲解得非常透彻，让我能够快速理解其中的逻辑和方法。作者们并没有仅仅停留在理论层面，而是结合了华大基因在国家基因库建设中的实际经验，分享了大量宝贵的实践案例和技巧。这些案例不仅仅是成功的经验，也包括了他们是如何克服困难、解决问题的，这对于我们这些初学者来说，无疑是极大的鼓舞和借鉴。读完之后，我感觉自己对于生物信息数据库的整体框架有了非常清晰的认知，并且跃跃欲试想要开始自己的数据库项目。

评分☆☆☆☆☆

我是一名有着多年生物信息分析经验的从业者，日常工作中经常需要与各种生物信息数据库打交道，也曾遇到过一些关于数据库维护和更新的棘手问题。坦白说，在阅读《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》之前，我对于“建设”和“管理”这两个环节的理解更多停留在“知道有这么回事”的层面，并没有深入探索过其背后的技术细节和管理策略。这本书的出现，彻底改变了我的看法。它不仅仅是一本技术手册，更是一本关于如何系统性思考和执行数据库项目的哲学指南。书中对于数据库的生命周期管理，从需求分析、规划设计，到实施部署、持续优化，都有着非常深刻的见解。我特别欣赏其中关于数据质量控制和安全性保障的部分，这往往是我们在日常工作中容易忽视但又至关重要的一环。作者们通过大量的图表和流程图，将复杂的概念可视化，使得我能够轻松理解数据一致性、完整性、可用性等关键指标的实现方式。此外，书中还探讨了如何利用最新的技术手段，如云计算、容器化等，来提升数据库的可扩展性和性能，这对我来说是极大的启发，也让我看到了未来生物信息数据库发展的新方向。

评分☆☆☆☆☆

自从接触到《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》这本书，我感觉自己对生物信息学领域，尤其是数据管理这一块的理解，上升到了一个全新的高度。我从事的是生物医药研发工作，数据是我们的核心资产，但如何高效地组织、存储、检索和利用这些数据，一直是我们的痛点。《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》这本书，就像为我们量身定制的指南。它没有那些艰涩难懂的专业术语，而是从实际应用的角度出发，详细讲解了如何构建一个满足科研需求的生物信息数据库。书中关于数据库的选型、架构设计、数据集成、以及如何实现数据共享和安全访问的章节，都提供了非常实用的建议。我尤其欣赏书中关于如何利用现有工具和技术，优化数据库性能，降低维护成本的探讨。这些内容对于我们这样的中小型研发机构来说，非常有价值，能够帮助我们更有效地管理数据，加速研发进程。读完这本书，我充满了信心，也对未来生物信息数据管理的发展方向有了更清晰的认识。

评分☆☆☆☆☆

作为一个非生物信息学背景，但对基因组学研究充满好奇的科学爱好者，我一直渴望能够更深入地了解支撑这些前沿研究的底层技术。《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》这本书，意外地成为了我跨入这个领域的一扇绝佳窗口。虽然我不是专业的数据库工程师，但书中对生物信息数据库的介绍，从其基本概念、重要性，到它在基因组学研究中的具体应用，都写得非常易懂。我特别喜欢书中关于数据标准化和互操作性的讨论，这让我理解了为什么不同的数据库之间能够相互连接，实现数据的共享和集成。作者们用了很多形象的比喻，将抽象的技术概念解释得生动有趣，让我即使在没有深厚专业知识的情况下，也能感受到生物信息数据库的魅力和价值。读完这本书，我不再仅仅是关注最终的研究成果，而是开始理解到，每一个伟大的科学发现背后，都有着强大而复杂的数据库系统在默默支撑。这本书让我看到了科技的严谨和力量，也激发了我继续探索生物信息学其他方面的兴趣。

评分☆☆☆☆☆

这本书很有参考价值，质量也不错。

评分☆☆☆☆☆

生物信息知识

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好

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好

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这本书很有参考价值，质量也不错。

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质量很好，内容丰富。

评分☆☆☆☆☆

不怎么样，彩色的。内容太简单

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不怎么样，彩色的。内容太简单

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不怎么样，彩色的。内容太简单