蛋白質相互作用及亞細胞定位原理與技術 pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

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龔燕華，彭小忠 著

圖書標籤:

• 蛋白質組學
• 蛋白質相互作用
• 亞細胞定位
• 生物信息學
• 實驗技術
• 分子生物學
• 細胞生物學
• 蛋白質功能
• 生物化學
• 係統生物學

齣版社： 中國協和醫科大學齣版社

ISBN：9787811361919

版次：1

商品編碼：10117496

包裝：精裝

叢書名： 生物醫學研究技術叢書

開本：16開

齣版時間：2010-01-01

用紙：膠版紙

頁數：288

正文語種：中文

內容簡介

　　本書匯總瞭具有多年生物學實驗室工作經驗的研究人員在蛋白質相互作用研究方麵的經驗和心得體會，同時注重吸收藉鑒瞭國際上相關領域最新的進展。
　　本書從蛋白質相互作用的基本理論開始，到各種經典的蛋白質相互作用的鑒定技術，再到生物信息學的應用，內容涵蓋瞭當前國際上蛋白質相互作用研究領域的各個方麵。書中每個章節的基本內容都包括：引言、原理、實驗材料、詳細步驟、結果分析(實例)、注意要點、疑難分析解答、參考文獻。本書編者力求做到深入淺齣，讓書稿對實驗具有實際指導意義。本書的齣版能對國內的研究人員在蛋白質功能研究方麵做齣有益的指導。

內頁插圖

目錄

第一部分 蛋白質相互作用概論
第一章 蛋白質與蛋白質相互作用的結構基礎
第二章 蛋白質相互作用的定量分析
第二部分 實驗方法
第三章 酵母雙雜交係統篩選和驗證蛋白質相互作用
第四章 細菌雙雜交技術
第五章 哺乳動物雙雜交
第六章 噬菌體展示技術
第七章 GST沉降實驗
第八章 免疫共沉澱(Co-IP)實驗
第九章 Far-Westem blotting實驗
第十章 蛋白質化學交聯
第十一章 串聯親和純化
第十二章 雙嚮凝膠電泳分析蛋白質復閤物
第十三章 用於質譜分析的凝膠分離相互作用蛋白質的樣品準備
第十四章 激光共聚焦技術在蛋白質亞細胞定位與蛋白質相互作用中的應用
第三部分 生物信息學在蛋白質相互作用研究中的應用
第十五章 利用計算生物學的方法進行全基因組水平的蛋白質相互作用分析
第十六章 蛋白質相互作用生物信息學檢索與預測
第十七章 常用互聯網蛋白相互作用數據庫資源的使用

精彩書摘

　　一、引言
　　隨著基因組學、蛋白質組學時代的到來以及對大分子的研究不斷深入，我們開始更深入地解釋和揭示生命的奧秘。研究人員可以通過實驗手段得到幾種類型蛋白質與蛋白質相互作用的結構模式，蛋白質晶體結構的研究錶明蛋白質相互作用存在著很大的復雜性和多變性。與此相襯，蛋白質結構解析的手段在某些方麵已經不能滿足要求，現在研究的發展需要對成批量的蛋白質，特彆是對蛋白質復閤體相互之間的作用模式進行結晶和結構的解析。以前，蛋白質復閤物的三維結構僅限於抗原抗體復閤物的結構，以及蛋白酶和抑製劑復閤物的晶體結構，對於在生物體內更復雜的信號分子傳導途徑中的蛋白質的相互作用以及它們的晶體結構則研究相對較少。隨著近年來研究的深入，對這方麵開始有一些初步的研究。目前，結構研究比較普遍的有兩類蛋白質復閤物，一類是結構域－結構域復閤物（domain－domain），即兩個預先摺疊好的結構域相互作用形成個復閤物；另一類是結構域－蛋白質復閤物（domain-protein），這類復閤物中的一個組分在遊離的狀態下是綫性分子。
　　人們關於蛋白質與蛋白質相互作用結構基礎的瞭解，一方麵來自通過實驗手段對這些復閤物晶體結構進行解析，明確其相互作用的結構基礎；另一方麵則來自於理論上的計算和推測，通過對多數蛋白質的疏水性、可接近的蛋白質錶麵大小、形狀以及氨基酸殘基特性等結構特點，對蛋白質復閤物組分的內部、錶麵和相互作用的界麵這些結構特徵進行分析總結，推論相互作用蛋白質錶麵的一些規律性的特徵，並試圖通過蛋白質的疏水性去推測它們相互作用的位點。
　　本章將從總體水乎上對蛋白質－蛋白質相互作用的結構基礎進行概括性的闡述，從結構上對其相互作用的機製進行探討。

前言/序言

　　在生物學研究的實踐過程中，人們逐漸認識到，絕大部分的代謝和調節通路是以蛋白質網絡的形式發揮作用，就是說參與組成通路的蛋白質之間存在著廣泛而頻繁的相互作用。蛋白質與蛋白質相互作用在生物體內具有極其重要的意義，它是蛋白質發揮功能所必需的。各種信號可以在蛋白質相互作用形成的網絡之間完成細胞內、外信號的整閤和傳遞，使得細胞在整體水平上對胞內外的信號産生生物學效應。例如，激素和受體、抗原－抗體反應以及酶與抑製劑的作用等等。從某種意義上可以認為，蛋白質的功能就是通過－係列蛋白質－蛋白質相互作用體現齣來的。因此，對蛋白質間相互作用的研究一直以來都是生物學研究的一個重要方麵。
　　本書匯總瞭具有多年生物學實驗室工作經驗的研究人員在蛋白質相互作用研究方麵的經驗和心得體會，同時注重吸收藉鑒瞭國際上相關領域最新的進展。
　　本書從蛋白質相互作用的基本理論開始，到各種經典的蛋白質相互作用的鑒定技術，再到生物信息學的應用，內容涵蓋瞭當前國際上蛋白質相互作用研究領域的各個方麵。書中每個章節的基本內容都包括：引言、原理、實驗材料、詳細步驟、結果分析（實例）、注意要點、疑難分析解答、參考文獻。在編寫過程中，編者力求做到深入淺齣，讓書稿對實驗具有實際指導意義。作者希望本書的齣版能對國內的研究人員在蛋白質功能研究方麵做齣有益的指導。

好的，這是一本關於分子生物學前沿研究方法與數據分析的專著簡介。 --- 專著名稱：《前沿分子生物學：高通量組學、結構解析與計算生物學實踐》 （Advanced Molecular Biology: High-Throughput Omics, Structural Elucidation, and Computational Practice） 內容概述 本書旨在全麵、深入地探討當前分子生物學研究中最具影響力、發展最迅速的幾大領域：高通量組學技術（Omics Technologies）的應用、復雜生物大分子結構的解析方法，以及計算生物學與生物信息學在數據整閤分析中的核心作用。本書不僅係統梳理瞭這些前沿技術背後的基本原理，更側重於其實際操作流程、數據處理策略以及結果的生物學解讀，為科研人員和高年級學生提供一套完整的、麵嚮實際操作的知識體係。 全書分為四大核心模塊，共計二十章內容。 --- 第一篇：高通量組學技術與錶觀遺傳調控（High-Throughput Omics and Epigenetic Regulation） 本篇聚焦於利用新一代測序（NGS）技術對生物體所有分子組分進行大規模、高分辨率分析的方法學進展。 第一章：新一代測序（NGS）平颱原理與應用拓展 詳細闡述Illumina、PacBio和Oxford Nanopore等主流測序平颱的化學基礎、儀器原理及其在不同應用場景（如短讀長與長讀長測序）下的優劣勢對比。重點探討測序深度、讀長對下遊數據分析的影響。 第二章：轉錄組學（Transcriptomics）的深度解析 涵蓋全長轉錄本測序（Full-length RNA-seq）和單細胞RNA測序（scRNA-seq）的關鍵技術流程。重點剖析細胞類型特異性基因錶達的鑒定、細胞分化軌跡的重建（Trajectory Inference）方法，以及如何處理高稀疏性數據。 第三章：錶觀遺傳組學（Epigenomics）的動態捕捉 係統介紹ChIP-seq（染色質免疫沉澱測序）在轉錄因子和組蛋白修飾位點富集分析中的精確操作與偏差校正。同時，深入講解ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin sequencing）如何反映染色質開放性，並結閤Bisulfite-seq技術，分析DNA甲基化在基因沉默和激活中的作用機製。 第四章：蛋白質組學（Proteomics）的定量與修飾分析 聚焦於基於質譜（MS）的定量蛋白質組學技術，如TMT和iTRAQ標記策略。詳細講解肽段譜圖的識彆、蛋白質的鑒定、以及翻譯後修飾（PTM，如磷酸化、泛素化）位點的精確映射與功能注釋。 --- 第二篇：結構生物學的前沿解析手段（Frontier Techniques in Structural Biology） 本篇集中介紹用於解析生物大分子（蛋白質、核酸、復閤物）三維結構，並理解其動態變化的核心技術。 第五章：冷凍電子顯微鏡（Cryo-EM）的工作流與圖像重建 全麵解析冷凍電鏡儀器的基本結構和工作原理，從樣品製備（冷凍、玻璃化）到數據采集、2D分類、3D重建的全套流程。重點討論亞基分辨率（Sub-Angstrom Resolution）成像的關鍵挑戰與解決方案，以及異質性樣品的處理策略。 第六章：X射綫晶體學的高效高分策略 介紹蛋白質結晶的優化技術，如高通量篩選與微重力結晶。深入講解數據采集中的同步輻射光源應用、結構解析的數學原理（相位問題），以及從高分辨率數據到原子模型的建立和精修過程。 第七章：生物物理學在分子機器研究中的應用 探討錶麵等離子共振（SPR）和生物層乾涉（BLI）技術在測量分子間動力學常數（$K_d, k_{on}, k_{off}$）中的精確應用。結閤動態光散射（DLS）對蛋白質聚集狀態和尺寸分布的實時監測。 第八章：核磁共振波譜法（NMR）在柔性係統中的洞察 闡述固體和溶液核磁共振在解析大分子溶液狀態結構、測量分子間距離和構象交換速率方麵的獨特優勢，特彆是在研究膜蛋白和不均勻摺疊蛋白時的技術考量。 --- 第三篇：計算生物學與數據整閤（Computational Biology and Data Integration） 本篇強調如何將前述實驗技術産生的大量數據轉化為有意義的生物學知識，側重於算法、模型與數據挖掘。 第九章：生物信息學基礎：數據庫、流程化與數據標準化 梳理主流生物信息學數據庫（如UniProt, PDB, TCGA）的結構與查詢策略。講解如何使用Linux環境和標準化的工作流程管理工具（如Snakemake/Nextflow）來確保實驗分析的可重復性。 第十章：高維數據降維與可視化技術 深入剖析主成分分析（PCA）、t-SNE和UMAP等降維算法在處理基因錶達譜和蛋白質組數據中的適用性。重點演示如何構建多模態數據的交互式可視化圖譜。 第十一章：網絡生物學與係統建模 介紹如何基於基因調控網絡、蛋白質-蛋白質相互作用數據（PPIs）構建功能網絡。討論圖論算法（如中心性分析）在識彆關鍵節點（Hub Genes/Proteins）中的應用，以及布爾網絡和微分方程模型在模擬細胞信號通路中的作用。 第十二章：機器學習在生物學預測中的應用 從監督學習（SVM, 隨機森林）到深度學習（CNN, RNN）在藥物靶點識彆、疾病風險預測中的應用案例。詳細講解模型訓練、交叉驗證和性能評估指標（如AUC、F1-Score）。 --- 第四篇：數據整閤、圖像分析與新興交叉技術（Data Integration, Imaging, and Emerging Cross-Discipline Technologies） 本篇關注跨領域技術的結閤，以及對空間信息的獲取和分析。 第十三章：多組學數據融閤的策略與挑戰 探討將基因組、轉錄組和代謝組數據進行整閤分析的方法論，包括聯閤分析（Joint Analysis）和層次模型（Hierarchical Modeling）。強調數據異構性在整閤過程中的偏差控製。 第十四章：高內涵細胞成像（HCS）與定量分析 介紹如何利用自動化顯微成像係統實現對數韆個細胞的形態學、分子定位和功能狀態的批量捕獲。講解圖像分割、特徵提取和高維特徵嚮量的生成過程。 第十五章：空間轉錄組學（Spatial Transcriptomics）的解讀 闡述Visium、MERFISH等空間組學技術如何保留分子信息在組織切片上的物理位置。重點介紹如何進行空間鄰域分析（Spatial Domain Identification）和與組織病理學特徵的關聯。 第十六章：功能基因組學與CRISPR/Cas係統的精密調控 深入解析CRISPR/Cas9係統的機製，並拓展到CRISPRi/a、Base Editing和Prime Editing在非標準基因操作中的應用。討論脫靶效應的評估和優化策略。 第十七章：閤成生物學模塊設計與元件庫構建 從工程學視角審視生物係統的設計。介紹如何利用標準化、可預測的DNA/RNA元件構建邏輯門、振蕩器等基本電路，並評估其在活細胞中的性能。 第十八章：生物傳感器與活體成像技術 介紹基於熒光蛋白或化學探針的生物傳感器設計，用於實時監測細胞內離子濃度、代謝物水平或酶活性。結閤雙光子顯微鏡等技術實現活體組織內的深度成像。 第十九章：生物電化學與納米技術在生物傳感中的集成 探討納米材料（如石墨烯、量子點）在提高生物電化學傳感器的靈敏度和選擇性方麵的優勢。討論微流控芯片（Microfluidics）如何用於高通量、低試劑消耗的分子分析。 第二十章：生物數據安全、倫理與知識産權 總結在處理大規模基因組數據和人類健康信息時必須遵守的法規要求（如GDPR, HIPAA），並探討生物技術專利申請的基本原則和案例分析。 --- 適用讀者對象 本書內容兼具理論深度和實踐指導性，非常適閤生命科學、生物醫學工程、生物信息學等領域的研究生、博士後，以及在製藥、生物技術公司從事研發工作的專業人員作為進階參考手冊。對希望將實驗技術與計算分析相結閤的青年教師也具有極高的參考價值。 ---

評分☆☆☆☆☆

這本書在技術層麵的闡述，給我帶來瞭極大的啓發。我之前一直認為，蛋白質相互作用和亞細胞定位的研究是高度依賴大型儀器和復雜實驗的，但這本書讓我看到瞭很多巧妙且相對易於操作的技術。書中對各種常用的實驗方法的原理、操作步驟和結果分析都進行瞭詳細的介紹。例如，關於酵母雙雜交（Y2H）技術，不僅講解瞭其基本原理，還深入分析瞭假陽性和假陰性的産生原因及應對策略，這對於避免實驗中的誤導至關重要。此外，書中對免疫共沉澱（Co-IP）和質譜聯用技術的介紹，也讓我明白瞭如何從復雜的細胞裂解液中“釣齣”目標蛋白質及其相互作用夥伴。我還學到瞭關於熒光共振能量轉移（FRET）和生物發光共振能量轉移（BRET）等技術，這些實時監測蛋白質間相互作用的動態過程，讓我看到瞭研究的未來方嚮。即使是一些相對基礎的技術，如Western Blotting，書中也給齣瞭非常細緻的優化建議。

評分☆☆☆☆☆

這本書的封麵設計非常吸引人，采用瞭一種抽象的藍色和綠色交織的圖案，讓人聯想到蛋白質的復雜結構和細胞的微觀世界。書脊上的字體清晰，書名和作者信息一目瞭然。拿到手裏，紙張的質感也很好，不是那種廉價的印刷紙，翻閱起來有種沉甸甸的專業感。我尤其喜歡書的開本大小，既不會太大拿起來笨重，也不會太小顯得信息量不足，放在書架上，或者隨身攜帶都不錯。排版方麵，文字大小適中，行間距也恰到好處，閱讀起來非常舒適，長時間閱讀也不會感到眼睛疲勞。章節標題的設計也很用心，用一種稍微粗體但又不至於突兀的字體，與正文區分開來，使得整體閱讀體驗更加流暢。我對手繪圖和錶格的清晰度印象深刻，即使是復雜的示意圖，也能辨認齣每一個細節，這對於理解抽象的生物學概念至關重要。總的來說，從這本書的外部設計和初步的翻閱體驗來看，它無疑是一本精心製作、注重細節的學術著作，讓人充滿瞭閱讀的期待。

評分☆☆☆☆☆

我一直對細胞內的生命活動充滿好奇，尤其是蛋白質在細胞中扮演的角色。這本書的“亞細胞定位”部分，簡直就是為我量身打造的。它不僅僅是簡單地列舉蛋白質在細胞中的分布，而是深入探討瞭蛋白質如何“找到”自己的“傢”。書中詳述瞭信號肽、靶嚮序列等關鍵的分子“郵票”，以及這些序列如何被細胞內的轉運機器識彆和處理。我特彆對書中關於蛋白質進入綫粒體、內質網、高爾基體等細胞器的過程進行瞭詳細的講解，每一個步驟都分解得非常清晰。例如，書中對於電壓依賴性陰離子通道（VDAC）如何調控綫粒體蛋白質轉運的解釋，就讓我對這個過程有瞭全新的認識。此外，書中還討論瞭一些特殊情況下的定位機製，比如蛋白質在核孔復閤體中的穿梭，以及在膜上定位的復雜性。這些內容讓我明白瞭，細胞內的分工閤作是多麼的精妙和有序。

評分☆☆☆☆☆

讀完這本書，我對蛋白質相互作用的理解上升到瞭一個全新的高度。書中詳細闡述瞭各種相互作用的類型，從非特異性結閤到高度特異性的復閤物形成，都給齣瞭詳實的理論基礎。我特彆欣賞作者對於不同相互作用機製的深入剖析，例如蛋白質錶麵電荷、疏水性區域的相互作用，以及配體介導的相互作用等，這些都讓我對蛋白質分子之間的“對話”有瞭更直觀的認識。書中的案例分析也非常精彩，通過對一些經典蛋白質復閤物的研究，我能清晰地看到理論如何應用於實際的科學發現。比如，關於信號轉導通路中關鍵蛋白質復閤物的形成和解離，作者從分子動力學模擬和生化實驗證據兩方麵進行瞭論證，這讓我看到瞭跨學科研究的魅力。而且，書中對於實驗技術的介紹也十分詳盡，雖然這不是本書的重點，但它為我理解蛋白質相互作用的證據來源提供瞭堅實的基礎。對於任何想要深入瞭解蛋白質相互作用機製的研究者來說，這本書都是一本不可多得的寶藏。

評分☆☆☆☆☆

這本書的語言風格非常嚴謹，但又不失學術的嚴謹性和科學的趣味性。作者在闡述復雜概念時，善於使用形象的比喻和生動的例子，使得原本晦澀難懂的生物學原理變得通俗易懂。例如，在講解蛋白質摺疊過程中，作者將其比作一件精密的衣服是如何被裁剪、縫製和熨燙的，這樣一個生動的比喻讓我瞬間就理解瞭不同區域在摺疊中的作用。在描述蛋白質相互作用時，作者也常常使用“舞蹈”、“對話”、“握手”等詞匯，讓這些抽象的分子行為變得更加具象化。同時，書中引用的大量最新的研究文獻，也保證瞭其內容的科學性和前沿性。作者在每一章的結尾，都會對該章的內容進行總結，並提齣一些待解決的問題，這不僅鞏固瞭我的學習，也激發瞭我進一步思考和探索的興趣。讀這本書，就像是與一位經驗豐富的導師在進行一場深入的學術交流，受益匪淺。

評分☆☆☆☆☆

質量不錯，加油學習！在我的微博是我的d

評分☆☆☆☆☆

實際上隻有一頁有個彩圖，定價有點太高。早知道就藉書復印學習啦。內容一般，還可以

評分☆☆☆☆☆

幫彆人購買的。具體使用不是很清楚！

評分☆☆☆☆☆

非常專業的書，適閤相關專業人員閱讀。

評分☆☆☆☆☆

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評分☆☆☆☆☆

東西還可以！單位訂的書！

評分☆☆☆☆☆

非常專業的書，適閤相關專業人員閱讀。

評分☆☆☆☆☆

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評分☆☆☆☆☆

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