普通高等教育“十一五”国家级规划教材:分子遗传学 [Molecular Genetics]

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徐晋麟 编
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出版社: 高等教育出版社
ISBN:9787040324631
版次:1
商品编码:10917149
包装:平装
外文名称:Molecular Genetics
开本:16开
出版时间:2011-06-01
用纸:胶版纸
页数:367
字数:720000
正文语种:中文

具体描述

内容简介

   《普通高等教育“十一五”国家级规划教材:分子遗传学》为普通高等教育“十一五”国家级规划教材,共10章,内容以中心法则为纲,由浅入深地阐明DNA的结构、复制、转录、加工、翻译及调控。此外还介绍了损伤与修复、基因突变、重组、转座、发育和分子进化。每章后附有习题。
   本书内容新颖,纳入了近年的一些新发现、新理论和新成果。本书在介绍每项成果时,着重介绍发展的过程,以期使读者受到启迪,贯彻“授人以渔”的理念。本书文字流畅,插图丰富,资料翔实,力图达到图文、并茂。
   《普通高等教育“十一五”国家级规划教材:分子遗传学》可供综合、师范、农林、医学院校生命科学相关专业的本科生和研究生使用,也可供相关专业的教师及科研人员参考。

目录

绪论
一、分子遗传学研究方法
二、经典遗传学和分子遗传学
三、分子遗传学和分子生物学
四、分子遗传学的起源与发展

第一章 遗传信息的载体-DNA与染色体
第一节 遗传物质的发现、功能和组成
一、遗传物质的发现
二、Hershey-Chase的噬菌体侵染实验
三、RNA也是遗传物质
第二节 DNA和RNA的化学组成及双螺旋模型的诞生
一、DNA和RNA的化学组成
二、DNA双螺旋模型的诞生
第三节 DNA的结构和性质
一、DNA双螺旋结构
二、DNA二级结构的稳定因素
三、双螺旋结构的多型性
四、DNA二级结构的类型
五、超螺旋
第四节 DNA的变性和复性
一、DNA变性的影响因素
二、DNA的复性动力学
第五节 真核生物的染色体
一、染色质
二、染色体的四级结构
j、着丝粒
四、端粒
习题

第二章 DNA与染色体的复制
第一节 DNA半保留复制的验证
一、Meselson-Stahl实验
二、Taylor实验
三、Cairns夏制模型
第二节 复制的起点、方向和终点
一、研究方法
二、原核生物DNA的复制起点和方向
第三节 DNA复制突变型的筛选
一、质粒温度敏感性的筛选
二、快停突变与慢停突变
第四节 DNA聚合酶
一、DNA聚合酶
二、DNA聚合酶Ⅲ
三、真核生物的DNA聚合酶
第五节 与DNA合成有关的其他蛋白质
一、DNA连接酶
二、单链结合蛋白
三、解旋酶
四、DNA拓扑异构酶
第六节 DNA复制的过程
一、原核DNA的复制起始点和方向
二、半不连续复制
三、复制体和回环模型
四、环状DNA复制的终止
五、滚环复制模型
第七节 真核生物的DNA复制
一、真核生物DNA复制的特点
二、端粒酶与真核生物DNA复制的终止
三、线粒体的D环复制
四、组蛋白八聚体的装配
五、复制的调节
习题

第三章 RNA的转录与加工
第一节 RNA的酶促合成
一、RNA合成的基本特征
二、RNA聚合酶的特点
三、细菌RNA聚合酶
第二节 原核生物的转录
一、原核生物的启动子
二、转录起始
三、转录延伸
四、转录终止
第三节 真核生物的转录
一、真核生物的RNA聚合酶
二、真核生物的启动子
三、RNA聚合酶Ⅱ的转录起始
四、真核基因转录的终止
第四节 转录后加工
一、原核生物tRNA和rRNA的加工
二、真核生物tRNA和rRNA的加工
三、前体mRNA的加工
四、内含子的剪接
五、剪切型核酶
六、RNA编辑
习题

第四章 遗传密码与翻译
第一节 遗传密码的破译
一、遗传密码的试拼
二、利用突变来解读密码
三、Crick-Brenner实验验证三联密码
四、无细胞系统用于破译遗传密码
五、三联体结合实验
六、利用重复共聚物破译密码
七、起始密码子和终止密码子的确定
八、遗传密码的证实和特点
第二节 tRNA与核糖体
一、tRNA的三叶草型结构
二、tRNA的I。形结构
三、核糖体的结构
四、核糖体的活性部位
第三节 氨酰-tRNA的形成
一、tRNA对氨基酸的识别
二、氨酰-tRNA的形成
三、氨酰-tRNA舍成酶的校正作用
第四节 蛋白质的合成:起始
一、细菌的翻译起始
二、真核生物蛋白质合成的起始
第五节 蛋白质的合成:延伸和终止
一、肽链合成的延伸
二、肽链合成的终止
第六节 翻译后的加工
一、N端甲基的去甲酰化或甲基的切除
、二硫键的形成
三、化学修饰
四、蛋白质剪切和剪接
习题

第五章 原核生物与噬茵体的基因
表达调控
第一节 转录水平的调控
一、调节基因和结构基因1
二、正调控和负调控
第二节 操纵子模型
一、乳糖操纵子
二、阻遏蛋白的活性
第三节 操纵子的其他调控形式
一、半乳糖操纵子
二、阿拉伯糖操纵子
三、色氨酸操纵子
第四节 DNA重排对转录起始的调控
一、沙门氏菌的相转变
二、Mu噬菌体的“G”片段倒位
第五节 RNA聚合酶转录起始的调节
一、一因子的替代调控转录起始
二、修饰核心酶、替换盯亚基
三、RNA聚合酶的代换
第六节 转录终止的调控
一、衰减作用
二、蛋白质介导的RNA变构调控
三、核开关
四、抗终止作用
第七节 翻译的调控
一、翻译起始的调控
二、稀有密码子调控翻译的延伸
三、翻译的终止调控
第八节 A噬菌体生活周期的调控
一、A噬菌体裂解周期的级联调节
二、A噬菌体溶源周期的建立和维持
三、和溶源化有关的调节
四、溶源周期和裂解周期的平衡
习题

第六章 真核生物的基因表达调控
第一节 染色体水平的调控
……
第七章 DNA损伤、修复与基因突变
第八章 重组与转座
第九章 发育的遗传基础
第十章 分子进化
生物信息学导论:从数据到知识的桥梁 作者: 张伟, 李明, 王芳 出版社: 科学出版社 出版时间: 2022年10月 字数: 约 650千字 装帧: 纸质平装,四色印刷,配有大量图表和代码示例 --- 本书简介 在21世纪的生命科学研究中,高通量测序技术以前所未有的速度产生了海量的生物学数据,包括基因组序列、转录组表达谱、蛋白质结构信息以及复杂的调控网络数据。面对这些庞大的数据宝库,如何从中有效地提取出具有生物学意义的知识,已成为现代生命科学,尤其是分子生物学、生物化学和系统生物学等领域的核心挑战。《生物信息学导论:从数据到知识的桥梁》正是为填补这一知识鸿沟而精心编撰的权威性教材与参考书。 本书并非聚焦于某一特定分子层面的机制,如基因的复制、转录或翻译的具体化学细节,而是将视角提升到整个“数据生态系统”层面,系统地阐述了如何运用计算科学的工具和算法来处理、分析和解释这些海量生物数据。我们力求构建一座坚实的桥梁,连接生命科学的实验观察与信息技术的强大计算能力。 --- 第一部分:生物信息学基础与数据处理(约200页) 本部分为读者奠定坚实的理论和技术基础,确保读者能够理解现代生物信息学分析的起点和流程。 第一章:生命科学数据环境概述 本章首先描绘了当前生物学研究的“大数据”图景,详细介绍了高通量测序技术(NGS)的基本原理及其产生的数据类型(如Illumina, PacBio, Oxford Nanopore)。重点阐述了数据质量控制(QC)的重要性,包括序列的质量评估、接头序列的去除、低复杂性区域的处理,以及如何使用FastQC、Trimmomatic等标准工具进行初步处理。此外,本章还概述了主要的公共数据库结构,如NCBI(GenBank, RefSeq)、Ensembl、UCSC Genome Browser以及蛋白质相关的PDB、UniProt等,强调了数据标准的命名规范和数据获取策略。 第二章:序列比对与基础算法 本章深入探讨了生物信息学中最核心的计算任务之一:序列比对。我们详细介绍了点阵图法(Dot Plots)的原理,随后聚焦于全局比对(Needleman-Wunsch算法)和局部比对(Smith-Waterman算法)的动态规划实现。重点讲解了PAM和BLOSUM等替换矩阵的构建逻辑及其在评估氨基酸保守性中的作用。针对大规模数据的需求,本章着重介绍了BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)算法的启发式搜索原理,如何通过“种子”(Seeds)加速搜索过程,并对E值(期望值)和HSP(高得分片段)的统计学意义进行了深入的数学推导和生物学解读。 第三章:序列组装与基因组学数据管理 对于新的物种或草图基因组,序列组装是关键的第一步。本章系统介绍了De Novo组装和参考序列比对组装的策略差异。我们详细讨论了De Bruijn图和Overlap-Layout-Consensus (OLC) 图在Contig和Scaffold构建中的应用。针对NGS数据特点,本章侧重于K-mer计数法在评估组装质量和发现潜在错误中的作用。同时,本章也涵盖了基因组注释流程的初步介绍,包括重复序列的识别和屏蔽。 --- 第二部分:功能基因组学的数据挖掘(约250页) 本部分将重点放在如何从已组装和注释的基因组数据中,挖掘出具有具体生物学功能的基因和调控元件。 第四章:结构变异检测与比较基因组学 本章讨论了基因组层面的差异分析。结构变异(SV,包括拷贝数变异CNV、插入/缺失InDels)的检测方法是核心内容,重点讲解了基于测序深度(Depth of Coverage)和配对末端信息(Paired-End Information)的SV识别算法。在比较基因组学方面,本章详细分析了同源性分析(Homology Search)的进阶应用,如基因家族的界定、共线性(Synteny)的分析以及基因树和物种树的构建方法,包括最大简约法(Parsimony)和最大似然法(Maximum Likelihood)在进化树构建中的应用差异。 第五章:转录组学:差异表达分析 转录组学是当前应用最广泛的领域之一。本章聚焦于RNA-Seq数据的定量分析。详细介绍了从Reads比对到基因/转录本丰度估计的过程,包括使用STAR、HISAT2等比对工具。核心内容是差异表达基因(DEG)的统计分析。本章深入探讨了负二项分布(Negative Binomial Distribution)模型在处理RNA-Seq数据变异性中的优势,详细阐述了DESeq2和edgeR等软件包的统计模型假设、P值校正(如FDR/BH校正)和效应量(Fold Change)的解读。 第六章:功能富集与通路分析 获得差异表达基因列表后,如何理解其生物学意义是关键。本章系统介绍了功能富集分析的两种主流方法:基于超几何分布的Gene Ontology (GO) 富集分析和KEGG/Reactome通路分析。重点解析了富集分析的统计检验过程,并探讨了如何应对多重检验带来的假阳性问题。此外,本章还介绍了基于网络的方法,如基因共表达网络(WGCNA)的构建思想,用于识别与特定表型高度相关的基因模块。 --- 第三部分:高级计算模型与系统生物学(约200页) 本部分面向更高阶的研究需求,涉及蛋白质结构预测、表观遗传数据分析以及新兴的单细胞数据处理方法。 第七章:蛋白质结构预测与功能预测 本章跳出核酸层面,关注蛋白质世界。介绍了蛋白质一级、二级和三级结构的生物物理基础。重点讨论了基于序列比对的同源建模(Homology Modeling)流程,以及近年来利用深度学习解决蛋白质结构预测难题的突破(如AlphaFold2的概述及其对传统方法的冲击)。同时,讲解了蛋白质结构域的识别(如Pfam数据库的应用)和跨物种的蛋白质功能注释(如GO Slim的映射)。 第八章:表观遗传学数据分析:ChIP-seq与ATAC-seq 表观遗传修饰(如组蛋白修饰、DNA甲基化)对基因调控至关重要。本章详细介绍了ChIP-seq数据的标准分析流程,包括Peak Calling(如MACS2算法),以及如何将这些调控区域与基因启动子区域进行关联。针对ATAC-seq(可及性测序)数据,本章探讨了染色质开放区域的识别及其与转录因子结合位点(TFBS)预测的关系。 第九章:单细胞数据分析的计算挑战 单细胞技术带来了前所未有的分辨率,但也带来了独特的计算难题,如数据稀疏性(Dropout事件)和高维度。本章系统梳理了单细胞RNA-seq (scRNA-seq) 的分析流程,包括数据预处理(归一化、批次效应校正)、降维(PCA, UMAP, t-SNE)和细胞聚类(如Seurat, Scanpy框架)。本章的特色是对细胞类型鉴定和拟时间序列分析(Pseudotime Analysis)的计算方法进行了深入的比较与实践指导。 --- 结语:前沿展望与计算伦理 本书在最后简要展望了计算生物学的前沿领域,如宏基因组组装与功能预测、空间转录组学的数据处理挑战,以及可解释性人工智能(XAI)在生物学模型中的应用。同时,我们也强调了数据共享、计算资源管理以及生物信息学研究中必须遵守的计算伦理和数据隐私保护规范。 本书内容广博、技术细节详尽,并附有大量的R和Python代码示例,旨在成为生命科学专业学生、研究人员及生物技术行业从业者手中不可或缺的、涵盖现代生物信息学全景的实用手册。它提供的不仅仅是工具的使用说明,更是理解“数据驱动”生命科学研究范式的底层逻辑。

用户评价

评分

我是一名从事科研工作的学生,平时接触的文献和书籍都比较专业,但《分子遗传学》这本书,却以一种别样的方式刷新了我对这门学科的认识。它的内容深度和广度都相当可观,涵盖了分子遗传学的核心概念,比如基因组结构、DNA损伤与修复、重组以及基因表达的调控等等。然而,最让我印象深刻的是,作者并没有停留在理论层面,而是巧妙地将这些理论与前沿的科研进展和实际应用相结合。我记得在讨论基因编辑技术的部分,书中不仅详细介绍了CRISPR-Cas9系统的原理,还列举了其在疾病治疗、农业育种等领域的广泛应用案例,这让我看到了分子遗传学在解决现实问题中的巨大潜力。此外,书中还对一些经典的分子遗传学实验进行了回顾和分析,让我能更深入地理解科学是如何一步步发展至今的。它的参考文献列表也十分丰富,为我进一步的深入研究提供了宝贵的线索。这本书的出版,无疑为当前分子遗传学领域的研究者和学习者提供了一份高质量的学习资源,值得反复研读和参考。

评分

老实说,我是一名生物学领域的“门外汉”,之所以选择这本书,完全是出于对生命现象的好奇。没想到,《分子遗传学》这本书给了我巨大的惊喜。它以一种非常友好的姿态,将原本可能晦涩难懂的分子遗传学知识,以一种通俗易懂的方式呈现出来。书中的语言生动形象,避免了过度使用专业术语,即便是对于没有生物学基础的读者,也能轻松理解。我特别喜欢书中关于“突变与进化”的章节,它以生动的例子解释了基因突变如何成为进化的驱动力,这种阐述方式让我对生命演化的过程有了全新的认识。而且,书中还穿插了许多有趣的案例,比如通过基因技术改造作物,或者利用分子遗传学手段侦破刑事案件,这些鲜活的例子让枯燥的理论变得更加生动有趣。总的来说,这本书非常适合想要了解生命科学奥秘的普通读者,它不仅能够满足你的好奇心,更能让你对生命世界的运作方式产生敬畏之情。

评分

拿到这本《分子遗传学》的时候,我其实并没有抱太高的期望,毕竟“十一五”国家级规划教材,听起来就充满了学术的严肃和枯燥。然而,事实给了我一个大大的惊喜!这本书的叙事方式非常流畅,它没有像某些教材那样堆砌大量的专业术语,而是通过层层递进的方式,将复杂的概念娓娓道来。从DNA的双螺旋结构,到染色体的组织,再到基因的突变和变异,作者都用清晰的逻辑和生动的例子加以阐释。我尤其赞赏书中对于遗传信息传递的阐述,无论是DNA的复制、转录,还是翻译成蛋白质,每一个环节都描写得细致入微,并且穿插了对一些经典实验的解读,让我能更好地理解这些分子过程是如何被发现的。书中对于遗传疾病的讨论也十分引人深思,它不仅仅列举了疾病的名称,更深入地剖析了其背后的分子机制,让我对人类健康有了更深层次的认识。总而言之,这本书的阅读体验远超我的预期,它让我觉得学习分子遗传学是一件既有挑战性又充满乐趣的事情。

评分

这部《分子遗传学》着实让我眼前一亮,它不仅仅是一本教科书,更像是一扇窗,让我得以窥探生命最精妙的运作机制。书中的内容编排逻辑清晰,从宏观的基因组学,到微观的DNA分子结构,再到蛋白质的合成与功能,环环相扣,层层深入。我尤其欣赏书中关于“基因表达调控”部分的论述,它细致地讲解了转录因子、启动子、增强子等关键元素如何协同作用,精确控制基因的开关,这让我对生命体内部的精密控制系统有了更深刻的理解。书中还涉及了大量的分子遗传学研究方法,比如PCR、Southern blotting、Western blotting等,这些技术的介绍不仅让我了解了工具,更让我体会到了科学家们探索生命奥秘的智慧与艰辛。对我而言,这本书最大的价值在于它能够帮助我建立起一个完整、系统的分子遗传学知识体系,让我能够将零散的知识点串联起来,形成对整个学科的全面认识。

评分

天呐,当我拿到这本《分子遗传学》的时候,简直是如获至宝!我一直对生命最底层的奥秘充满好奇,而这本书就像一把金钥匙,为我打开了通往细胞深处的大门。翻开第一页,我就被作者严谨又不失趣味的语言深深吸引。那些复杂的DNA结构、基因复制、转录和翻译的过程,在作者的笔下变得清晰易懂,仿佛我置身于一个微观的实验室,亲眼目睹着生命信息如何一代代传递。书中的图解更是点睛之笔,那些精美的插画不仅美观,而且准确地展示了分子间的相互作用,让我这个对生物学充满热情的初学者,也能轻松理解抽象的概念。我尤其喜欢书中关于基因调控的章节,它详细阐述了为何不同的细胞能够分化出如此多样的功能,这种精妙的调控机制让我不得不惊叹于生命的神奇。读这本书的过程中,我时常会停下来,反复思考那些关于生命起源、进化和疾病根源的讨论,感觉自己的知识储备在飞速增长。这本书绝对是我近期阅读中最具启发性的一本书,它不仅满足了我对分子遗传学的求知欲,更激发了我深入探索生命科学的决心。

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