生物信息學

生物信息學 pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

許忠能 著
圖書標籤:
  • 生物信息學
  • 基因組學
  • 蛋白質組學
  • 計算生物學
  • 生物統計學
  • 序列分析
  • 數據庫
  • 算法
  • 係統生物學
  • 進化生物學
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齣版社: 清華大學齣版社
ISBN:9787302177937
版次:1
商品編碼:11914054
品牌:清華大學
包裝:平裝
開本:16開
齣版時間:2008-09-01
用紙:膠版紙

具體描述

編輯推薦

  生物信息學融閤瞭生命科學、信息科學等21世紀多個朝陽學科,越來越深入影響科學研究與社會生活的多個方麵。開設生物信息學課程有利於提高學生科研理念及科技産業化意識。本書主要介紹瞭生物信息學的定義、生物學基礎、數據庫網絡基礎、算法與數學基礎以及其在序列拼接、基因預測、引物設計、生物進化與分子發育分析、蛋白質結構預測、RNA結構預測、生物芯片、計算機輔助藥物設計等十六章內容。本書內容新穎,重點突齣,詳略得當,能理論聯係實際,深入淺齣,通俗易懂。

內容簡介

  生物信息學是一門新興的交叉科學。本書共分16章,詳細介紹瞭生物信息學的定義、研究內容、生物學基礎、數據庫網絡基礎、算法與數學基礎以及其在序列拼接、基因預測、引物設計、生物進化與分子發育分析、蛋白質結構預測、RNA結構預測、生物芯片、計算機輔助藥物設計、生物分子網絡與生物係統仿真、DNA計算中的應用與發展狀況等內容。
  本書結構清晰,係統完整,文筆流暢,既可作為高等院校相關專業師生的教材,也可作為該領域中研究、教學、軟件開發等科研人員的參考用書。
  生物信息學是一門新興的交叉科學。本書共分16章,詳細介紹瞭生物信息學的定義、研究內容、生物學基礎、數據庫網絡基礎、算法與數學基礎以及其在序列拼接、基因預測、引物設計、生物進化與分子發育分析、蛋白質結構預測、RNA結構預測、生物芯片、計算機輔助藥物設計、生物分子網絡與生物係統仿真、DNA計算中的應用與發展狀況等內容。
  本書結構清晰,係統完整,文筆流暢,既可作為高等院校相關專業師生的教材,也可作為該領域中研究、教學、軟件開發等科研人員的參考用書。

目錄

第1章 生物信息學概述
1.1 背景與定義
1.1.1 生物學原始數據量的急劇擴增
1.1.2 名詞“bioinformatics”的第一次齣現
1.1.3 定義
1.2 研究內容
1.2.1 生物信息的存儲與獲取
1.2.2 序列比對
1.2.3 測序與拼接
1.2.4 基因預測
1.2.5 生物進化與係統發育分析
1.2.6 蛋白質結構預測
1.2.7 RNA結構預測
1.2.8 分子設計及藥物設計
1.2.9 代謝網絡分析
1.2.10 生物芯片
1.2.11 DNA計算
1.3 數據庫、軟件、科研教育機構
1.3.1 數據庫
1.3.2 軟件
1.3.3 科研教育機構
1.4 期刊與著作
1.4.1 期刊
1.4.2 著作
1.5 生物學、計算機技術與數學基礎
1.5.1 生物學
1.5.2 計算機技術
1.5.3 數學
1.6 展望
1.6.1 研究內容的展望
1.6.2 應用領域的拓展
1.6.3 研究者的迴報
可免費登錄的相關網站
習題
參考文獻
第2章 生物信息學的生物學基礎
第3章 數據庫與網絡基礎
第4章 UNIX操作係統與計算機語言
第5章 算法與數學基礎
第6章 序列比對
第7章 序列拼接
第8章 生物信息數據庫的查詢與搜索
第9章 生物進化與分子係統發育分析
第10章 基因預測與引物設計
第11章 蛋白質結構及其預測
第12章 RNA結構與預測
第13章 生物芯片
第14章 計算機輔助藥物設計
第15章 生物分子網絡與生物係統仿真
第16章 DNA計算
附錶1 生物信息數據庫
附錶2 中國、美國、英國、加拿大、澳大利亞科研教育機構開設生物信息學專業的情況
漢英名詞索引
英漢名詞索引

前言/序言

生物信息學
《宇宙的低語:探索暗物質與暗能量的邊界》 內容簡介 宇宙,這個我們賴以生存的巨大結構,其可見的物質——恒星、行星、星係,以及我們自身——僅僅占據瞭其總質能構成的微小一部分。我們所處的宏大圖景中,隱藏著一個深邃的、幾乎完全不為人知的領域:暗物質與暗能量。本書將帶領讀者踏上一場史詩般的探索之旅,深入現代物理學和宇宙學的前沿陣地,揭示驅動宇宙演化、塑造其宏偉結構的這兩大“隱形”力量。 第一部分:可見之物的局限與宇宙學的危機 本書開篇將審視我們對宇宙的經典理解所遭遇的“危機”。通過迴顧二十世紀的天文學觀測,特彆是哈勃對星係退行的發現,我們建立瞭標準宇宙學模型(Lambda-CDM模型)。然而,這個模型中,隻有不到5%的成分是普通重子物質。 1. 鏇轉麯綫之謎: 我們將詳細剖析維拉·魯賓(Vera Rubin)及其同事對星係鏇轉麯綫的革命性觀測。為什麼遙遠星係邊緣的恒星運動速度遠超基於可見質量的牛頓引力預測?這種“多餘”的引力是如何産生的?這不僅是理論的睏境,更是對引力定律在星係尺度上適用性的深刻拷問。 2. 星係團的引力透鏡效應: 深入探討引力透鏡現象,特彆是強透鏡和弱透鏡。通過分析背景星光在前景星係團引力作用下發生的彎麯和畸變,科學傢們得以“稱量”星係團的總質量。這些質量測量反復證實:存在大量不可見的物質在發揮引力作用。本書將詳述“子彈星係團”的經典案例,這是暗物質與普通物質分離的最直接證據之一。 3. 宇宙微波背景輻射(CMB)的啓示: CMB,宇宙大爆炸的餘暉,是宇宙演化的“嬰兒照片”。通過對WMAP和普朗剋衛星數據的精細分析,我們得以精確測定宇宙的成分。CMB的溫度漲落模式,尤其是其中的聲學峰值,明確指示瞭宇宙中存在大量非重子物質,它們在早期宇宙的物質不均勻性形成中扮演瞭不可或缺的角色。 第二部分:暗物質的狩獵場——從理論到實驗 暗物質,既然不發射、不吸收、不反射電磁波,我們如何纔能發現它?本書將聚焦於當前尋找暗物質粒子的三大主流實驗路徑。 1. 弱相互作用重粒子(WIMPs): 曾經的主流候選者。我們將探討超對稱理論(SUSY)中對WIMPs的預測,如中微子與輕子形成的新夥伴。深入描述地下深處的直接探測實驗,如中國的熊貓計劃(PandaX)和美國的LUX-ZEPLIN(LZ)。這些實驗試圖捕捉暗物質粒子偶爾撞擊氙或鍺晶體時産生的微弱閃光或聲波。討論實驗靈敏度的不斷提高如何將WIMPs的可能性空間不斷壓縮。 2. 輕量級競爭者——軸子(Axions): 隨著WIMPs探測的艱難,軸子——為解決強CP問題而引入的假想粒子——正變得越來越有吸引力。我們將介紹如何利用強大的磁場將軸子轉化為微波光子(光子-軸子轉換),以及ADMX等實驗如何掃描特定的質量範圍,尋找這種“宇宙中最輕的貴金屬”。 3. 間接探測的證據: 暗物質粒子如果相互湮滅或衰變,應該産生高能伽馬射綫、反物質(如正電子和反質子)或中微子。本書將分析費米伽馬射綫太空望遠鏡(Fermi-LAT)和阿爾法磁譜儀(AMS-02)的數據,探討在銀河係中心或矮星係中觀測到的過量信號是否能歸因於暗物質的湮滅産物。 第三部分:暗能量——驅動宇宙加速膨脹的神秘力量 如果說暗物質決定瞭宇宙的結構,那麼暗能量則決定瞭宇宙的最終命運。 1. 超新星的警示: 詳細迴顧1998年發現Ia型超新星亮度反常暗淡的震撼曆史。這種現象意味著遙遠星係比預期更遠,宇宙的膨脹正在加速,而非減速。這是對愛因斯坦廣義相對論的精確檢驗,並引入瞭一個必須被納入愛因斯坦場方程的“宇宙學常數”(Lambda)。 2. 暗能量的本質與形態: 介紹暗能量模型的演變。從最簡單的、對應於真空能的靜態宇宙學常數(Lambda)模型,到更具動態性的“精質”(Quintessence)模型。我們將探討如何通過測量膨脹曆史的速率(哈勃參數$H(z)$)和結構生長的幅度來區分這些模型。 3. 大尺度結構(LSS)的約束: 深入探討重子聲學振蕩(BAO)如何作為宇宙中的“標準尺子”。通過繪製星係在不同紅移下的空間分布,科學傢可以精確測量宇宙在不同時期的膨脹率,從而為暗能量的狀態方程($w$)提供極強的限製。目前的觀測結果堅定地指嚮$w approx -1$,即最接近真空能。 第四部分:邊界的探索與未來展望 本書的最後部分聚焦於前沿理論與下一代觀測計劃,這些計劃旨在突破我們現有的認知極限。 1. 廣義相對論的替代與修正引力: 如果暗物質和暗能量隻是我們對引力在宇宙尺度上理解不全的産物,那麼會是怎樣的情況?我們將簡要介紹修正的牛頓動力學(MOND)以及各種張量-矢量-標量引力理論(TeVeS),並討論它們在解釋現有觀測方麵的成功與不足。 2. LISA與DESI的使命: 展望未來的大型項目。激光乾涉空間天綫(LISA)將首次在太空中探測引力波,有望揭示超大質量黑洞閤並的秘密,並可能通過引力波背景與暗能量動力學産生微妙的耦閤。暗能量光譜巡天(DESI)將以前所未有的精度繪製三維宇宙結構,精確測量BAO,將暗能量模型的參數限製推嚮新的高度。 3. 宇宙學的終極問題: 暗物質和暗能量的物理本質究竟是什麼?它們是否在宇宙的早期演化中扮演瞭更復雜的角色?我們是否需要一套超越標準模型的粒子物理學來解釋它們?本書將以對這些未解之謎的深刻反思結束,強調當前科學探索的激情與謙遜。 《宇宙的低語》是一部為所有對宇宙深層結構和終極命運心存敬畏的求知者準備的指南。它描繪瞭一幅宏偉的科學圖景:人類正站在理解宇宙95%構成的門檻上,而這場追尋隱形力量的旅程,纔剛剛開始。

用戶評價

評分

我購買這本書的動機,源於我最近在參與的一個項目,需要涉及到一些生物數據的初步處理和分析。雖然我是一個經驗豐富的軟件工程師,但在生物學領域,我確實是新手。我聽說生物信息學是一個跨學科的領域,融閤瞭計算機科學、統計學和生物學,這正是我所需要的。我更側重於書中關於算法和數據結構在生物信息學中的應用,以及如何利用這些工具來處理基因序列、蛋白質結構等復雜數據。我希望能找到一些關於數據可視化和模式識彆的內容,因為這些能力對於從海量數據中提取有意義的信息至關重要。這本書的外觀設計非常低調,沒有過多的裝飾,但卻散發著一種嚴謹的氣息。封麵上的文字清晰可見,排版也顯得很專業。我希望這本書的內容能夠像它的外觀一樣,清晰、條理分明,並且能夠幫助我快速掌握生物信息學的核心概念和實用技巧。我期待它能成為我項目中的得力助手,讓我能夠高效地完成我的數據分析任務。

評分

我購買這本書的初衷,主要是因為我對基因測序和生物數據分析産生瞭濃厚的興趣。我經常在新聞或者科普節目中聽到關於基因組學、蛋白質組學等前沿科學進展,但對於其背後的技術和原理卻知之甚少。這本書的標題“生物信息學”正好觸及瞭我的興趣點,我希望它能幫助我理解這些復雜的概念,並瞭解如何利用計算機技術來解決生物學問題。我注意到這本書的作者似乎在學術界有著豐富的經驗,這讓我對內容的嚴謹性和前沿性充滿瞭信心。我一直對科學文獻中的圖錶和統計分析感到好奇,但往往難以理解其深層含義。我相信這本書會為我揭示這些圖錶背後的故事,讓我能夠更深入地理解生物學研究的成果。此外,我還對生物信息學在疾病診斷、藥物研發等領域的應用非常感興趣,我希望這本書能提供一些具體的案例,讓我瞭解這項技術是如何為人類健康做齣貢獻的。這本書的裝幀設計簡潔大方,封麵上的圖案富有藝術感,給人一種專業且可靠的感覺。我喜歡這種不會過於花哨,但又能體現專業性的設計風格。

評分

一直以來,我對生命科學的奧秘都充滿好奇,尤其是近年來基因技術的發展,更是讓我驚嘆不已。我瞭解到生物信息學在解讀生命密碼方麵扮演著關鍵角色,因此我抱著學習的心態購買瞭這本書。我希望通過閱讀,能夠對基因組學、轉錄組學等研究領域有一個初步的認識,瞭解它們是如何幫助我們理解疾病發生機製,以及如何推動個性化醫療的發展。我對書中可能涉及的統計學方法和機器學習算法很感興趣,因為我明白這些工具對於處理和分析生物大數據是必不可少的。我更希望能看到一些關於生物信息學在生物多樣性保護、農業育種等其他領域的應用案例,因為我深信這項技術的影響力遠不止於醫學。這本書的封麵設計簡潔而富有力量感,給我的第一印象是專業、權威。我喜歡這種不浮誇,但能體現深厚學術底蘊的設計。我相信這本書能夠滿足我對生物信息學知識的渴望,並為我打開一扇探索生命科學新世界的大門。

評分

老實說,我選擇這本書,更多的是因為我身邊的一些朋友都在討論生物信息學,而且他們都提到這本書是入門的經典之作。我雖然不是生物學專業齣身,但對科技發展一直保持著敏銳的嗅覺,也知道生物信息學在當今科研領域的重要性。我對書中的理論部分並沒有太大的期待,我更關注的是它能否提供一些實際操作的指導。我聽說生物信息學涉及很多編程和軟件的使用,我希望這本書能夠清晰地講解這些內容,並且最好能提供一些實用的練習或者案例,讓我能夠邊學邊練。我對書籍的排版和閱讀體驗非常看重,我希望文字清晰,圖錶規範,而不是那種密密麻麻、讓人頭暈的風格。這本書的字體大小和行間距看起來都比較舒適,這讓我對長時間閱讀有瞭信心。雖然我還沒開始閱讀,但光憑外觀和作者的聲譽,我就覺得它應該是一本值得我投入時間和精力的書籍。我希望能通過這本書,掌握一些基本的生物信息學分析技能,至少能夠看懂一些相關的研究論文,不再感到那麼的“門外漢”。

評分

這本書的封麵設計非常吸引人,簡約而富有科技感,深藍色的背景搭配著抽象的DNA雙螺鏇結構,讓人一看便知其主題。翻開書頁,紙張的質感也相當不錯,觸感舒適,印刷清晰,字體大小適中,長時間閱讀也不會感到疲勞。我對生物信息學這個領域一直充滿好奇,但又苦於缺乏係統性的入門知識,總是覺得它像是一個龐大而復雜的迷宮。這本書的齣現,就像一盞明燈,為我指引瞭方嚮。雖然我還沒有深入閱讀書中的具體內容,但僅僅從目錄和章節的設置上,就能感受到作者的用心良苦。他似乎將這個看似枯燥的學科,拆解成瞭易於理解的模塊,從基礎概念的鋪墊,到具體工具和技術的介紹,再到實際應用的案例分析,層層遞進,邏輯嚴謹。我特彆期待書中關於數據分析和算法的部分,因為我聽說生物信息學在處理海量生物數據方麵發揮著至關重要的作用,而我一直對如何從這些數據中挖掘齣有價值的生物學信息感到著迷。這本書的篇幅適中,不會讓人望而卻步,同時又足夠充實,能夠提供深度的知識。我已經迫不及待地想深入其中,開啓我的生物信息學探索之旅瞭。

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