新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版） pdf epub mobi txt 电子书 下载 2025

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[美] 吴，C.Chen 著

图书标签:

• 蛋白质组学
• 比较蛋白质组学
• 生物信息学
• 新生物学丛书
• 影印版
• 生命科学
• 生物技术
• 基因组学
• 蛋白质分析
• 生物化学

出版社： 科学出版社

ISBN：9787030369901

版次：01

商品编码：11213680

包装：平装

丛书名： 新生物学丛书

开本：16开

出版时间：2013-03-01

用纸：胶版纸

页数：404

正文语种：英文

内容简介

　　随着蛋白质组学技术自身及其在生命科学与医学应用中的快速发展，许多生物信息学方法、数据库和软件被开发出来并成功用于比较蛋白质组学研究。在《新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）》中，专家描述了相关领域中最新的现状、挑战、所面临的开放性问题、以及未来的发展趋势。《新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）》内容涉及发展比较蛋白质组学研究所需的生物信息学工具和资源，为了解该领域提供了具有相当广度和深度的知识体系和引用参考。这些对于在实验中获得理想的结果至关重要。《新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）》内容全面、易于使用，对所有希望了解蛋白质组学数据分析和系统生物学层面上比较蛋白质组学的生物信息学数据库、工具、新计算方法及其未来发展趋势的读者都有所裨益。

目录

Preface

Contributors

PART I： BIOINFORMATICS FRAMEWORK FOR COMPARATIVE PROTEOMICS

1 Protein Bioinformatics Databases and Resources

Churning Chen， Hongzhan Huang， and Cathy H． Wu

2 A Guide to UniProt for Protein Scientists

Claire O'Donovan and Rolf Apweiler

3 InterPro Protein Classification

Jennifer McDowall and Sarah Hunter

4 Reactome Knowledgebase of Human Biological

Pathways and Processes

Peter D'Eustachio

5 eFIP： A Tool for Mining Functional Impact

of Phosphorylation from Literature

Cecilia N． Arighi， Amy Y． Siu， Catalina O． Tudor，

Jules A． Nchoutrnboube， Cathy It． Wu， and Vijay K． Shanker

6 A Tutorial on Protein Ontology Resources for Proteomic Studies

Cecilia N． Arighi

7 Structure-Guided Rule-Based Annotation． of Protein

Functional Sites in UniProt Knowledgebase

Sona Vasudevan， C．R． Vinayaka， Darren A． Natale，

Hongzhan Huang， Robel Y． Kahsay， and Cathy H． Wu

PART II： PROTEOMIC BIOINFORMATICS

8 Modeling Mass Spectrometry-Based Protein Analysis

Jan Eriksson and David Feny

9 Protein Identification from Tandem Mass Spectra

by Database Searching

Nathan J． Edwards

10 LC-MS Data Analysis for Differential

Protein Expression Detection

Rency S． Varghese and Habtorn W． Ressom

11 Protein Identification by Spectral Networks Analysis

Nuno Bandeira

12 Software Pipeline and Data Analysis for MS/MS Proteomics：

The Trans-Proteomic Pipeline

Andrew Keller and David Shteynberg

13 Analysis of High-Throughput ELISA Microarray Data

Amanda M． White， Don S． Daly， and Richard C． Zangar

14 Proteomics Databases and Repositories

Lennart Martens

15 Preparing Molecular Interaction Data for Publication

Sandra Orchard and Henning Hermjakob

16 Submitting Proteomics Data to PRIDE Using PRIDE Converter

Harald Barsnes， Juan Antonio Vizcalno， Florian Reisinger，

Ingvar Eidhammer， and Lennart Martens

17 Automated Data Integration and Determination of

Posttranslational Modifications with the Protein Inference Engine

Stuart R． Jefferys and Morgan C． Giddings

18 An Integrated Top-Down and Bottom-Up Strategy

for Characterization of Protein Isoforms and Modifications

Si Wu， Nikola Toli， Zhixin Tian， Errol W． Robinson，

and Ljiljana Paa- Toli

PART III： COMPARATIVE PROTEOMICS IN SYSTEMS BIOLOGY

19 Phosphoproteome Resource for Systems Biology Research

Bernd Bodenmiller and Ruedi Aebersold

20 Protein-Centric Data Integration for Functional Analysis of

Comparative Proteomics Data

Peter B． McGarvey， Jian Zhang， Darren A． Natale，

Cathy H． Wu， and Hongzhan Huang

21 Integration of Proteomic and Metabolomic Profiling

as well as Metabolic Modeling for the Functional

Analysis of Metabolic Networks

Patrick May， Nils Christian， Oliver Ebenhh，

Wolfram Weckwerth， and Dirk Walther

22 Time Series Proteome Profiling

Catherine A． Formolo， Michelle Mint4 Asako Takanohashi，

Kristy J． Brown， Adeline Vanderver， Brian Halligan，

and Yetrib Hathout

Index

前言/序言

好的，这里为您提供一本名为《细胞信号转导：基础与前沿》的图书简介，内容将详细描述该书的核心主题、结构和潜在读者群体，同时避免提及您提供的“新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）”的任何内容。 --- 图书名称：《细胞信号转导：基础与前沿》 图书简介 一、 概述：生命活动的精密调控 《细胞信号转导：基础与前沿》是一部全面深入探讨生命体细胞如何感知、处理和响应外界及内部环境变化的权威性著作。细胞信号转导是现代生命科学研究的核心领域之一，它构成了生命活动得以精确、有序执行的底层逻辑。本书旨在系统梳理信号转导通路的基本原理、关键分子机制，并追踪该领域最前沿的研究进展和应用潜力。 本书突破了传统教科书对单一信号通路的孤立讲解模式，强调信号网络的复杂性、动态性以及跨通路交叉互作的整体视角。通过整合分子生物学、细胞生物学、生物化学以及系统生物学的最新见解，本书为读者提供了一幅高清的细胞通讯蓝图。 二、 核心内容与结构 本书内容结构严谨，逻辑清晰，共分为六大核心部分，覆盖了从基础概念到尖端技术的完整知识体系。 第一部分：信号转导基础理论与分子元件 本部分奠定了信号转导的理论基石。首先介绍了信号的产生、信号分子（激素、生长因子、细胞因子等）的分类及其受体结合的分子动力学。重点解析了膜上受体（如GPCRs、受体酪氨酸激酶RTKs、离子通道相关受体）的结构、活化机制及其跨膜信号的初级传递过程。此外，还详细阐述了胞内第二信使系统（cAMP, $ ext{IP}_3/ ext{DAG}$, $ ext{Ca}^{2+}$等）在放大和分发信号中的关键作用，并对信号转导中的磷酸化/去磷酸化级联反应进行了系统的化学和结构解析。 第二部分：主要信号通路详解 这是本书内容最为详尽的部分，系统剖析了当前研究热点和经典的核心信号通路： 1. MAPK通路家族： 深入探讨了ERK、JNK和p38等通路在细胞增殖、分化和应激反应中的特异性调控机制，包括其上游的Ras/Raf的精确激活过程。 2. $ ext{PI3K}/ ext{Akt}/ ext{mTOR}$通路： 详细分析了这一在细胞生长、代谢和凋亡中占据中心地位的通路，特别是其在营养感应和癌症发生中的枢纽作用。 3. $ ext{JAK}/ ext{STAT}$通路： 聚焦于细胞因子和免疫应答中STAT家族转录因子的激活、核易位及基因表达调控。 4. $ ext{NF-}kappa ext{B}$信号网络： 阐述了其在炎症、免疫和细胞存活中的关键调控环路，包括其复杂的激活和抑制机制。 5. $ ext{Wnt}$与$ ext{Hedgehog}$信号： 探讨了这两条在胚胎发育和组织再生中至关重要的信号通路，及其在轴向模式形成中的精确时空控制。 第三部分：信号网络的整合与调控 本部分关注信号转导的复杂性——“网络”而非“线性通路”。内容涵盖： 信号的串扰与交叉互作： 分析不同通路如何相互影响，形成复杂的反馈和前馈调控回路。 时空特异性： 探讨细胞如何利用信号分子的扩散梯度、受体内吞和信号蛋白的亚细胞定位来精确控制信号的传递时间和地点。 信号的“记忆”与适应性： 讨论细胞如何通过表观遗传修饰或蛋白稳定性的变化对持续或重复的信号做出不同反应。 第四部分：信号转导与细胞命运决定 本部分将信号通路与具体的细胞生物学结果挂钩，重点讨论信号转导在以下过程中的核心作用： 细胞周期调控与增殖： 细胞周期检查点与关键信号通路（如$ ext{Rb}$通路）的联动。 细胞凋亡（程序性细胞死亡）： 详细解析内在和外在凋亡通路（如$ ext{Caspase}$激活）的信号级联。 细胞迁移与粘附： 信号通路如何重塑细胞骨架，指导细胞的定向移动。 干细胞命运决定： 阐述维持干细胞特性和诱导其分化所需的关键信号环境。 第五部分：信号转导的前沿研究技术 为了跟上领域发展，本书专门辟出章节介绍用于研究信号转导的先进技术手段： 活细胞成像技术： FRET、BRET、光遗传学（Optogenetics）在实时监测信号分子相互作用和蛋白活化状态中的应用。 高通量筛选技术： 利用CRISPR、siRNA库筛选信号通路中的新组分。 化学生物学工具： 探针和抑制剂的设计与应用，用于解析特定信号节点的精确功能。 生物信息学与系统生物学建模： 如何利用计算模型来预测信号网络的动态行为。 第六部分：信号转导的临床转化与应用 本部分聚焦于将基础知识转化为治疗策略的实践： 信号通路与疾病： 详细分析癌症、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病）、糖尿病和自身免疫性疾病中信号转导的失调机制。 靶向治疗策略： 介绍目前已上市和正在临床试验中的信号通路抑制剂（如激酶抑制剂）的作用原理和面临的耐药性挑战。 新兴疗法： 探讨基于信号通路调控的新型免疫疗法和基因治疗策略。 三、 目标读者 本书内容深度与广度兼备，特别适合以下群体： 1. 生命科学、生物医学、药学等相关专业的高年级本科生及研究生： 可作为系统学习信号转导模块的专业教材或参考书。 2. 科研工作者与实验室技术人员： 为从事细胞生物学、免疫学、肿瘤生物学和神经科学研究的人员提供深入的理论背景和技术参考。 3. 制药及生物技术行业的专业人士： 帮助理解药物作用靶点和开发新疗法的分子基础。 通过对《细胞信号转导：基础与前沿》的学习，读者将不仅掌握信号转导的经典知识，更能理解当前生命科学研究的前沿方向，为未来的研究和创新打下坚实的基础。

评分☆☆☆☆☆

这本书的内容深度和广度都超乎我的预期，它不仅仅是对某一特定领域的浅尝辄止，而是将比较蛋白质组学这个复杂的主题，通过生物信息学的视角进行了系统性的梳理和深入的探讨。我尤其欣赏其中关于数据处理和分析部分的讲解，作者并没有简单地罗列算法和工具，而是详细阐述了每一种方法的原理、适用场景以及潜在的局限性。这对于我们这些非生物信息学专业出身，但又希望在这个领域有所突破的研究者来说，无疑是雪中送炭。书中穿插的案例分析也非常有说服力，让我能够更直观地理解抽象的理论概念，并将其与实际研究问题联系起来。虽然某些章节的难度系数不低，需要反复咀嚼，但正是这种深入的讲解，才真正体现了这本书的价值。我发现很多在文献中难以找到的细节，在这本书里得到了清晰的解答，这极大地节省了我查阅大量资料的时间和精力。

评分☆☆☆☆☆

这本书的装帧和纸张质量相当不错，拿在手里很有分量感，我特别喜欢这种略带磨砂质感的封面，不容易沾染指纹，而且印刷字体清晰，排版也很规整，即使长时间阅读也不会觉得疲劳。书页的裁剪边缘处理得也很到位，没有毛糙感，整体给人一种专业、严谨的感觉。当然，作为一本影印版，它在一些细节上可能不如最新的精装图书那样完美，比如个别页面的墨迹深浅略有差异，或者封面上的字体压印深度不一，但这丝毫不会影响核心内容的阅读体验，反而增添了一种复古的学术气息。我个人比较看重图书的物理触感和视觉呈现，这本书在这方面确实做得很好，让我觉得物超所值。而且，作为一个经常需要携带书籍出行的人，它的尺寸也很适中，不会显得过于笨重，可以轻松放入我的背包中。总体来说，这是一本外观和触感都令人满意的图书，让人在翻阅时就能感受到作者和出版方对学术研究的尊重。

评分☆☆☆☆☆

我是一名初入蛋白质组学研究领域的研究生，最初对“生物信息学”这个词感到有些畏惧，认为它门槛很高。但是，当我翻开这本书后，我的疑虑被打消了。作者的写作风格非常循序渐进，从最基础的概念讲起，逐步引入更复杂的分析技术。语言表达清晰易懂，即使是那些我之前从未接触过的术语，也能在上下文的帮助下逐渐理解。书中还提供了很多实用的代码示例和操作指南，这对于我这样的初学者来说，简直是无价之宝。我尝试着跟着书中的步骤进行了一些简单的分析，发现操作起来并没有想象中那么困难。这本书让我对生物信息学在比较蛋白质组学中的应用有了全新的认识，并且培养了我独立进行数据分析的信心。我非常感激作者能够用如此友好的方式，将如此专业的技术呈现出来，让我能够顺利地踏上这条学术之路。

评分☆☆☆☆☆

这本书最大的亮点在于它将理论知识与实践应用巧妙地融合在一起。它不仅仅是枯燥的理论堆砌，而是通过大量的实例和案例研究，生动地展示了生物信息学在比较蛋白质组学研究中的实际操作。我尤其喜欢书中对不同研究问题的分析思路和解决方案的呈现，这让我能够看到，生物信息学是如何真正地服务于解决生物学难题的。通过这些案例，我不仅学习到了具体的分析技术，更重要的是，我学会了如何将这些技术应用到自己的研究项目中。书中提供的多种分析策略和评估标准，也帮助我更好地设计实验和解释结果。这本书记住了我研究生涯中的“盲点”，为我打开了新的思路。我发现，在阅读这本书的过程中，我自身的科研能力也在潜移默化中得到了提升。

评分☆☆☆☆☆

这本书的内容更新速度确实令人赞叹。考虑到生物信息学技术日新月异的发展，我一直担心自己阅读的书籍会很快过时。然而，这本书在介绍核心概念的同时，也紧跟了最新的技术进展和研究趋势。它不仅涵盖了比较蛋白质组学的经典分析方法，还引入了一些新兴的算法和工具，让我能够了解到当前该领域最前沿的研究动态。书中对于不同算法的比较和权衡分析，也为我选择合适的工具提供了宝贵的参考。我发现，书中提到的很多方法论，都是我最近在阅读最新文献时经常遇到的。因此，这本书就像一个及时的“知识更新器”，让我能够更好地理解和消化最新的学术成果。这对于需要不断追踪前沿信息的研究者来说，是至关重要的。

评分☆☆☆☆☆

印刷质量还可以，送货到家很方便

评分☆☆☆☆☆

英文的，专业性强，内容很系统。

评分☆☆☆☆☆

英文的，专业性强，内容很系统。

评分☆☆☆☆☆

挺好的，质量不错，便宜，速度快

评分☆☆☆☆☆

京东速度不错，书也还行。

评分☆☆☆☆☆

包装呀唉

评分☆☆☆☆☆

Bioinformatics for Comparative Proteomics影印版，英文书，印刷还是很清楚的，这本书的内容一共包括三个部分，第一部分是主要内容是比较蛋白质组学生物信息学的基本框架，包括蛋白质数据库的资源，指南，蛋白质分类等，第二部分主要讲述了蛋白质组学的一些数据分析的算法，第三部分主要讲述了比较蛋白组学，内容还是不错的。

评分☆☆☆☆☆

好书，值得购买，英文原版太久了！

评分☆☆☆☆☆

包装呀唉